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生物化学重庆医药高等专科学校 张静文哺乳类动物基因组DNA 约 3 × 10 9 碱基对编码基因 约有 40000 个,占总长的6%rDNA等重复基因 约占 5% ~ 10%一、真核生物基因组结构特点1、真核基因组结构庞大2、染色质的独特结构 DNA与组蛋白、非组蛋白和少量RNA等其它物质相结合,组蛋白可以保护DNA免受损伤,维持稳定,调节表达。高度重复序列(106 次)多拷贝序列中度重复序列(103 ~ 104次)单拷贝序列(一次或数次)3、单顺反子即一个编码基因转录生成一个mRNA分子,经翻译生成一条多肽链。4、重复序列(正向重复、反向重复)5、基因不连续性——断裂基因6、基因家族 ---是指核苷酸序列或编码产物的结构具有一定程度同源性的一组基因。 同一家族的基因成员是由同一祖先基因进化而来。其编码产物常常具有相似的功能。 基因家族中,某些成员并不能表达出有功能的产物,这些基因称为假基因,表示为“Ψ”。哺乳动物中普遍存在这一现象。可能由突变产生。二、真核生物基因表达调节的特点1、组织特异性表达和时相性 真核生物和原核生物的分界线是真核生物染色体由一层核膜所包围,真核生物转录和翻译在时空上是分隔的;原核生物是紧密偶联的。(1)时间特异性/阶段特异性(2)空间特异性/细胞特异性/组织特异性转录方向负超螺旋RNA-pol正超螺旋2、活性染色体结构变化(1)对核酸酶敏感活化基因常有超敏位点,位于调节蛋白结合位点附近。(2)DNA拓扑结构变化天然双链DNA均以负性超螺旋构象存在。基因活化后(3)DNA碱基修饰变化 真核DNA约有5%的胞嘧啶被甲基化,甲基化范围与基因表达程度呈反比。CpG岛—甲基化常发生在某些基因的5’侧翼区的CpG序列(4)组蛋白变化① 富含Lys组蛋白水平降低② H2A, H2B二聚体不稳定性增加③ 组蛋白修饰④ H3组蛋白巯基暴露3、正性调节占主导 真核基因基因组大,通过利用各种转录因子正性激活RNA聚合酶是真核基因调控的主要机制。 —— 特异性强,更精确,更经济 4、多级调节系统 在转录前、转录、转录后与翻译、mRNA降解、翻译后、转运等不同水平分别进行调控。短期调节(可逆)-环境、代谢物对合成的影响。长期调节(不可逆)-发育中的细胞决定和分化。(1)DNA水平调节(转录前)①染色质的丢失—— 不可逆调节②基因扩增 ——增加基因拷贝数③基因重排 ——主要调节方式④DNA甲基化 —甲基化与基因表达呈负相关(2)转录水平调节RNA聚合酶活性调节Britten-Davidson模型mRNA传感蛋白+激素Britten-Davidson模型整合基因(受体基因)结构基因受体序列传感基因stDNASTS1S2Z1Z2C激活蛋白(3)转录后水平调节① mRNA前体加工对基因表达调节的影响② mRNA的剪接对基因表达调节的影响③ mRNA运输的控制(4)翻译水平的调节①翻译起始的调节:阻遏蛋白的调节;起始因子的调节;5′AUG(不是起始密码子)的调节; 5′非编码区长度的影响等。②mRNA稳定性调节③小分子RNA的影响三、真核生物基因转录起始的调节1、顺式作用元件与结构基因表达相关、能够被转录因子识别和结合的DNA序列.(1)启动子是RNA聚合酶结合位点周围的一组转录控制组件,至少包括一个转录起始点以及一个以上的功能组件。典型的启动子:CAAT盒和(或)GC盒 + TATA盒 + 转录起始点最简单的启动子:TATA盒 + 转录起始点有的启动子没有GC盒 或TATA盒 2. 增强子(enhancer)指远离转录起始点、决定基因的时间、空间特异性、增强启动子转录活性的DNA序列,其发挥作用的方式通常与方向、距离无关。特点①在转录起始点5’或3’侧均能起作用;②相对于启动子的任一指向均能起作用;③发挥作用与受控基因的远近距离相对无关;④对异源性启动子也能发挥作用;⑤通常具有一些短的重复顺序。 3. 沉默子(silencer)某些基因的负性调节元件,当其结合特异蛋白因子时,对基因转录起阻遏作用。2、反式作用因子 细胞中具有使基因开放或关闭功能的序列特异性DNA结合蛋白同一DNA序列可被不同蛋白质识别。同一蛋白质因子可与多种不同DNA序列发生联系,少数是直接结合,多数是蛋白质-蛋白质相互作用后再影响DNA。蛋白质-蛋白质或DNA-蛋白质的结合,均导致构象上的微细变化,构象变化常是实现调控功能的分子基础。反式作用因子在自身生物合成过程中,有相当大的可变性和可塑性。3、转录起始的调节(1)反式作用因子的活性调节①表达式调节 ②共价修饰 ③配体结合(2)反式作用因子与顺式作用元件的结合(3)反式作用因子的作用方式①成环 ②扭曲 ③协同(4)反式作用因子的组合式调节作用
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