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;重组DNA连接、转移、筛选与鉴定;1 粘性末端连接;粘性末端连接;;
两个具有平末端的双链DNA分子连接。
问题:低效率、串珠现象;;
利用末端转移酶在载体及外源双链DNA的3‘端各加上一段寡聚核苷酸,如dA(dG)和dT(dC),制成人工粘性末端;
然后在DNA连接酶的作用下, 连接成为重组的DNA分子。
;重组DNA连接--同聚物加尾法 ; 将人工合成的或来源于现有质粒的一小段DNA分子(在这一小段DNA分子上有某种限制性内切酶的识别序列), 加到载体或外源DNA的分子上, 然后通过酶切制造粘性末端,再进行连接的方法。 ;连接反应体系(20μl):;1、反应温度:16度;
2、时间:过夜或1h;
3、DNA量:50-100ng;
4、载体与目的DNA比例 1:8(摩尔比);
5、酶量
;重组DNA连接、转移、筛选与鉴定;
接合 (conjugation):当细胞之间、细菌间通过菌毛相互接触时,质粒DNA 从一个细胞(细菌) 至另一细胞(细菌)的转移。
转导(transduction):???当病毒(噬菌体)从被感染的(供体)细胞释放出来、再感染另一(受体)细胞时,发生DNA转移及基因重组。
转座(transposition ):有些基因可以从一个位置移动到另一位置,由可移动的DNA 序列(插入序列和转座子)介导。;
基因转移过程中,不同DNA分子间发生的共价连接称基因重组。
包括位点特异性的重组(整合酶催化)和
同源重组两种类型。
发生在同源序列间的同源重组,又称基本重组。
同源重组依赖两分子间序列的相同或相似性,将外源DNA整合进宿主染色体。
;体外重组DNA的转移;热击法(氯化钙法);外源基因导入组织或细胞的一种物理学转化方法。
基因枪(gene gun)
微粒轰击法(microparticle bombardment):
将载有外源基因的微米/亚微米级的金属微粒(钨或金粉)加速,高速轰击并射入受体靶细胞的方法。
;基因工程的基本过程分(合成)、切、连、转、选、鉴;电穿孔(electroporation)转化:;;重组DNA连接、转移、筛选与鉴定;酶切鉴定;;;核酸杂交;基因工程的基本过程分(合成)、切、连、转、选、鉴;1.引起核酸变性的因素:
酸、碱、热、变性剂(尿素、胍)
有机溶剂(乙醇、丙酮)
2.核酸的复性(Renaturation)退火:
互补单链重新缔合成双链的过程。
影响复性速度的因素:
DNA大小;离子强度;DNA浓度;
;核酸杂交;Southern 杂交;Southern 杂交;;
能与特定核苷酸序列发生特异性互补杂交,杂交后又能被特殊方法检测的已知被标记的核苷酸序列。
分类:
1. 同位素标记
2. 非同位素标记:地高辛 (digoxygenin, DIG) 标记核酸探针,利用抗 DIG 的抗体通过酶联免疫反应检测。
;
1.缺口平移法
2.随机引物法
;基因工程的基本过程分(合成)、切、连、转、选、鉴;Southern blotting;原位杂交;基因工程的基本过程分(合成)、切、连、转、选、鉴;菌落杂交;基因工程的基本过程分(合成)、切、连、转、选、鉴;斑点杂交?;Western Blotting;
加入特异抗性体(一抗),膜上的目的蛋白(抗原)与一抗结合后,再加入能与一抗专一性结合的带标记的二抗(通常一抗用兔来源的抗体时,二抗常用羊抗兔免疫球蛋白抗体);
二抗上带标记化合物(一般为辣根过氧化物酶或碱性磷酸酶);
通过特异性反应显色进行检测。 ;构建基因文库筛选目的基因;;按照外源 DNA 片段的来源,基因文库分为:
基因组 DNA 文库(genomic DNA library):
cDNA 文库(complementary DNA library):
cDNA 是由生物的某一特定器官或特定发育时期细胞内的 mRNA 经体外反转录后形成的双链 cDNA,
再将这些cDNA与合适的载体重组后导入宿主细胞。,这一组重组子带有该种生物的所有蛋白的编码基因。
;基因组文库构建;基因组文库构建过程:;;;文库筛选:;基因工程的基本过程分(合成)、切、连、转、选、鉴;2. 菌液PCR;通过自动印迹或光引导化学合成技术在硅片、玻璃、凝胶或尼龙膜上制造的生物分子微阵列。
根据分子间的特异作用的原理,实现对细胞、蛋白质、基因等生物组分的准确、快速、大信息量的检测。;基因芯片(DNA 芯片):;微型化:每平方厘米固体表面上可固定十万个 DNA 片段、数万个基因。一次分析可得到数万个基因的表达信息。
样品用量与试剂用量的微量化,纳克级的 mRNA 、微升级的杂交液。???
自动化?:芯片制作及分析过程,杂交、洗片、芯片结果读取与扫描与数据处理
都可实现自动化,
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