导师定制的个性化生物信息学课程教学研究.docxVIP

导师定制的个性化生物信息学课程教学研究.docx

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导师定制的个性化生物信息学课程教学研究 开放科学(资源服务)标识码(OSID): Abstract Bioinformatics is an important research tool in the field of life sciences, but there are practical problems in the teaching of nonbioinformatics major postgraduates. In order to solve the above problems, this research carried out the teaching of personalized bioinformatics courses customized by the supervisor, which effectively improved the teaching quality of bioinformatics and better served the research and thesis work. The research results were applicable to life sciences related majors, such as agriculture, forestry, medicine and pharmacy, etc. Key words Supervisor customization;Bioinformatics;Postgraduate course teaching 基金项目 中南民族大学研究生教育教学改革基金项目(yjsjg*****)。 作者简介 徐鑫(1978—),男,河南南阳人,副教授,博士,从事植物分子遗传学研究。 收稿日期 2019-03-15 生物信息学是一门发展迅速的新兴学科,涵盖了生物信息的获取、加工、存储、分配、分析、解释等各个方面,综合运用數学、计算机科学和生物学的各种工具来阐明和理解大量数据所包含的生物学意义。近年来,基础和应用生命科学领域内生物信息学的应用已经大大改变了知识研究和开发的体系及方式。生物信息学已成为一种重要且不可替代的生物学研究工具,涵盖了生命科学的各个领域及研究方向。在研究的早期阶段,生物信息学可以帮助确定研究内容并阐明研究计划,从而降低研究结果的不确定性;在研究中,可以简化实验数据的分析过程,从而缩短研究时间,提高研究成功率;对于研究结果,可以探索内在联系和相关性,以提高研究结果的分析深度。 基于生物信息学的重要性,几乎所有生命科学相关高等院校及专业的研究生课程均开设了生物信息学课程[2-3]。然而,在实际教学过程中,“供”与“需”之间存在矛盾,导致教学效果不理想。笔者分析了目前非生物信息学专业研究生的生物信息学课程教学中存在的主要问题,开展了导师定制的个性化生物信息学课程教学,以期提高生物信息学的教学质量,服务于研究生后继的课题研究及论文工作。 1 非生物信息学专业研究生的生物信息学课程教学中存在的问题 (1)生物信息学学科迅速发展,其涵盖内容的深度和广度不断扩大,课程教学内容要适应 “大数据”时代带来的新方法、新资源和新思路。然而,对于非生物信息学专业学生而言,生物信息学主要作为一种必不可少的研究辅助工具,运用生物信息学的方法来解决生物研究中遇到的问题,不需要掌握生物信息学算法或软件编程细节。此外,对于一些不属于生物信息学定义所规定范畴的计算机和网络技术及方法(例如文献检索、管理和学术报告的制作等),也有很大的需求。 (2)对于非生物信息学专业的研究生而言,虽然主要教学目的是要求学生掌握一些基本软件的应用及相关数据库的使用,但在原理的理解以及最重要的结果判断分析上需要学生具有扎实的生物化学、分子生物学、遗传学及细胞生物学知识。由于学生的生源学校及专业不同,学生在上述课程上的基础存在巨大差异。同样的情况,生物信息学课程基础也有显著差异。在本科阶段,有完全没有学习或者接触过生物信息学的同学;在学过生物信息学的学生中,对生物信息学的掌握程度也存在较大差异,有的同学只有理论学习,有的同学掌握了部分相关实践操作,部分同学利用生物信息学进行过相关工作。以上先导课程和生物信息学课程2个基础的差异造成了教学过程难以做到兼顾。 (3)我国高校硕士研究生教育的课程学习大多集中在一年级,多数学生尚未进入课题研究阶段。由于对自己研究内容的不了解,无法把握研究中的生物信息学需求,从而进行选择性地重点吸收。另外,目前面向研究生的生物信息学课程是多个专业的合班课程,缺少专业及研究针对性,学生学到的是非本专业、非本研究方向的是一般性原则

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