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第四章 生物分子数据库主讲人：孙 啸 制作人：刘志华东南大学 吴健雄实验室第一节 引言生物分子数据高速增长 分子生物学及相关领域研究人员迅速获得最新实验数据 建立生物分子数据库 生物分子数据库应满足5个方面的主要需求（1）时间性（2）注释 （3）支撑数据 （4）数据质量 （5）集成性 生物分子数据库 一级数据库数据库中的数据直接来源于实验获得的原始数据，只经过简单的归类整理和注释 二级数据库对原始生物分子数据进行整理、分类的结果，是在一级数据库、实验数据和理论分析的基础上针对特定的应用目标而建立的 。生物分子数据库几个明显的特征：（1）数据库的更新速度不断加快 数据量呈指数增长趋势 （2）数据库使用频率增长更快 （3）数据库的复杂程度不断增加 （4）数据库网络化 （5）面向应用（6）先进的软硬件配置第二节 核酸序列数据库核酸序列数据的增长趋势（纵轴代表总的核酸序列长度，单位：百万bp） 三个数据库中的数据基本一致，仅在数据格式上有所差别，对于特定的查询，三个数据库的响应结果一样。 这三个数据库是综合性的DNA和RNA序列数据库，每条记录代表一个单独、连续、附有注释的DNA或RNA片段。 以下着重介绍EBMLMBL中的数据分类情况（单位：Gigabases）（EST-Expressed sequence tags; STS-sequence tagged sites）21