微生物的分类.pptxVIP

第十一章 微生物的分类和鉴定;微生物分类：是按M的亲缘关系相似程度把M归入各分类单元或分类群（taxon），以得到一个反映M进化的自然分类系统，可供鉴定用的检索表以及可给出符合逻辑的名称的命名系统。 任务：分类（classification），鉴定（identification）与命名（namenclature） 步骤：（获得纯培养物后） 1.据形态特征鉴别其属于哪一大类（B，A，Y，M）。 2.据其生理生化特征，生态特征，免疫特征和遗传特征等。借助于检索表或鉴定手册来依次确定是属于哪个目，科，属，种。 3.最后与该种的模式种加以???较并命名。;第一节 微生物的分类单元;一、种以上的分类单元 二、种以下的分类单元 ;目前正式分类单元;㈠亚种（Subspecies,subsp,ssp.）——是种的进一步细分的单元，一般是指在某一个特征上与模式种有明显而稳定差异的菌株。 例：金黄色葡萄球菌的厌氧亚种 Staphylococcus aureas subsp. anaerobius ㈡变种（Variety,var.）（一般认为是亚种的同义词，现不主张使用） 例：蜡状芽孢杆菌的荧光变种 Bacillus cereus var. fluorescens 产黄绿色荧光色素。 ㈢型（form）（曾用作菌株的同义词，现已废除，仅作若干变异型的后缀）。 例：生物变异型（biovar），形态变异型（morphovar），致病变异型（pathovar），噬菌变异型（phagevar）血清变异型（serovar）等。 ㈣菌株（strain），又称品系：一个菌株是指由一单细胞繁衍而来的克隆或无性繁殖系中的一个M或M群体。 ;㈣菌株;一些菌株;㈤培养物（culture）：是指一定时间一定空间内微生物细胞群或生长物。 ㈥居群（population）（群体、种群、群丛）：是指一定空间中同种个体的组合。每一个物种在自然界中的存在，都有一定空间结构，在其分散的、不连续的居住场所或分布区域内，形成不同的群体单元，这些群体单元称为～。;第二节 微生物的命名;一、双名法;二、三名法——对亚种的命名;第三节 微生物的分类依据和方法;一、常规分类法;二、遗传特征分类法;㈠DNA（G+C）mol% 值;㈡核酸杂交 ;（DNA-DNA杂交一般用于测定有密切关系（种或种内）微生物间的相似性；DNA-rRNA分子杂交用于检查关系较远的微生物间的相似性。）;㈢rRNA寡核苷酸分类目录 ; ; 3.实验方法（以16SrRNA为例）：;三、化学特征分类法 ⒈ 全细胞水解液的糖型 ⒉ CW化学成分 ⒊ 脂肪酸组成 ⒋ 分支菌酸 ⒌ 磷脂 ⒍ 醌 ⒎ 多胺分析 ⒏ 可溶蛋白质谱;四、数值分类法;⒋ 系统聚类（或等级聚类） ⒌ 聚类结果的表示;第四节 微生物在生物界的地位 （自习）;;⒈《伯杰氏鉴定细菌学手册》 （Bergey′s Manual of Deteminative Bacteriology） 第一版（1923年）；第七版（1957年）；第八版（1974年）；第九版（1994年） ⒉《伯杰氏系统细菌学手册》 （Bergey′s Manual of Systematic Bacteriology） 第一版（1984年）――四卷； 第二版（2000年）――五卷。;二、Ainsworth等人的菌物分类系统纲要;思考题;微生物分类：是按M的亲缘关系相似程度把M归入各分类单元或分类群（taxon），以得到一个反映M进化的自然分类系统，可供鉴定用的检索表以及可给出符合逻辑的名称的命名系统。 任务：分类（classification），鉴定（identification）与命名（namenclature） 步骤：（获得纯培养物后） 1.据形态特征鉴别其属于哪一大类（B，A，Y，M）。 2.据其生理生化特征，生态特征，免疫特征和遗传特征等。借助于检索表或鉴定手册来依次确定是属于哪个目，科，属，种。 3.最后与该种的模式种加以比较并命名。;一些菌株;㈤培养物（culture）：是指一定时间一定空间内微生物细胞群或生长物。 ㈥居群（population）（群体、种群、群丛）：是指一定空间中同种个体的组合。每一个物种在自然界中的存在，都有一定空间结构，在其分散的、不连续的居住场所或分布区域内，形成不同的群体单元，这些群体单元称为～。;一、双名法; 3.实验方法（以16SrRNA为例）：;