进化树分析与相关软件使用说明.pdfVIP

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进化树分析及相关软件使用说明  进化树分析及相关软件使用说明  我在此介绍几个进化树分析及其相关软件的使用和应用围。这几个软件分别 我在此介绍几个进化树分析及其相关软件的使用和应用围。这几个软件分别 PHYLIP PUZZLE PAUP TREEVIEW CLUSTALX PHYLO-WIN LINUX PHYLIP PUZZLE PAUP TREEVIEW CLUSTALX PHYLO-WIN LINUX 是 、 、 、 、 和 ( )。  是 、 、 、 、 和 ( )。  在介绍软件之前,我先简要地叙述一下有关进化树分析的一些方法学问题。  在介绍软件之前,我先简要地叙述一下有关进化树分析的一些方法学问题。  Phyligenetic tree” Phyligenetic tree” 进化树也称种系树,英文名叫 “ 。对于一个完整的进化树分析 进化树也称种系树,英文名叫 “ 。对于一个完整的进化树分析 To align s qu nc s To align s qu nc s 需要以下几个步骤:⑴ 要对所分析的多序列目标进行排列( )。 需要以下几个步骤:⑴ 要对所分析的多序列目标进行排列( )。 ALIGNMENT CLUSTALX CLUSTALW 做ALIGNMENT 的软件很多,最经常使用的有CLUSTALX 和CLUSTALW ,前 做 的软件很多,最经常使用的有 和 ,前 WINDOW DOS To WINDOW DOS To 者是在 下的而后者是在 下的。⑵ 要构建一个进化树 ( 者是在 下的而后者是在 下的。⑵ 要构建一个进化树 ( r construt phylig n tic tr r construt phylig n tic tr )。构建进化树的算法主要分为两类:独立元素法 )。构建进化树的算法主要分为两类:独立元素法 discr t charact r m thods distanc m thods discr t charact r m thods distanc m thods ( )和距离依靠法 ( )。所谓独立元素法 ( )和距离依靠法 ( )。所谓独立元素法

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