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- 2021-07-02 发布于湖南
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用 MEGA构建进化树
如何用 MEGA 构建进化树
MEGA3 、 1 就是一个关于序列分析以及比较统计的工具包 ,其中包括有距离建树法与
MP 建树法 ;可自动或手动进行序列比对 ,推断进化树 ,估算分子进化率 ,进行进化假设测验 ,还
能联机的 Web 数据库检索。 下载后可直接使用 ,主要包括几个方面的功能软件 :i)DNA 与蛋白
质序列数据的分析软件。 ii) 序列数据转变成距离数据后 ,对距离数据分析的软件。 iii) 对基因
频率与连续的元素分析的软件。 iv) 把序列的每个碱基 /氨基酸独立瞧待 (碱基 / 氨基酸只有 0
与 1 的状态 )时 ,对序列进行分析的软件。 v) 绘制与修改进化树的软件 ,进行网上 blast 搜索。
用 MEGA 构建进化树有以下步骤 :
1、 16S rDNA
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