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基于线粒体Cytb基因的黄海南部和东海银鲳群体遗传结构分析 赵峰 基于线粒体Cytb基因的黄海南部和东海银鲳群体遗传结构分析lowbar;赵峰 第35卷 第5期 ACTA HYDROBIOLOGICA SINICA 2021年9月 DOI: 10.3724/SP.J.1035.2021.00745 Vol. 35, No.5 Sep., 2 0 1 1 基于线粒体Cyt b 基因的黄海南部和东海银鲳群体遗传结构分析 赵 峰 庄 平 章龙珍 施兆鸿 (中国水产科学研究院东海水产研究所, 农业部海洋与河口渔业资源与生态重点开放实验室, 上海 200090) 摘要: 采用线粒体DNA 细胞色素b 基因片段为遗传标记, 对黄海南部和东海银鲳(Pampus argenteus) 群体的遗传结构进行了分析。在所分析的6个采样点116个个体中, 共检测到40种单倍型。6个群体均呈现出高单倍性多样性(0.647—0.895) 和低核苷酸多样性(0.0008—0.0026) 的特点。单倍型邻接关系树的拓扑结构简单, 未呈现明显的地理谱系结构。分子方差分析和F st 显示银鲳的遗传变异来自群体内个体间, 而群体间无显著遗传分化。Exact 检验表明单倍型在两两群体间分布频率的差异不显著。研究结果表明, 黄海南部、东海银鲳群体间具有高度的基因交流, 是一个随机交配群体。较强的扩散能力, 黄海、东海的海洋环流以及近期的群体扩张可能是造成黄海南部、东海银鲳群体间遗传同质性较高的原因。 关键词: 银鲳; 细胞色素b ; 野生群体; 遗传多样性 中图分类号: Q346 文献标识码: A 文章编号: 1000-3207(2021)05-0745-08 银鲳(Pampus argenteus) 隶属于鲈形目(Perciformes)、鲳科(Stromateidae)、鲳属(Pampus ), 广泛分布于我国渤海、黄海、东海及南海沿岸[1], 是我国重要的海洋经济鱼类之一。近20年来, 在高强度捕捞及环境变迁等因素的影响下我国东海区野生银鲳呈现个体变小, 性成熟提早的趋势[2], 银鲳资源的保护和持续利用引起了人们的关注。研究物种的基因多样性可以了解种群遗传结构, 可以为合理保护策略的制定提供基础数据和参考[3]。目前, 关于我国银鲳遗传多样性及遗传分化等方面还未见系统报道, 仅见许光平等[4]、孟彦羽等[5]、彭士明等[6]分别以同工酶、RAPD 和线粒体DNA(mtDNA)CO Ⅰ基因为标记对我国沿海银鲳群体的遗传多样性进行过初步报道。 线粒体DNA 遵循严格的母系遗传, 无遗传重组, 通常能够全面反映种群内和种群间的遗传变异, 被广泛的用于探讨种群遗传结构或有机体变异历 史[3, 7, 8]。Cyt b 基因是线粒体13个蛋白编码基因中结构和功能被研究得最为清楚的基因之一, 且进化速度适中, 适合种群水平差异的检测[9], 在水产动 物种群遗传多样性研究中得到了广泛应用并取得了良好的结果。本研究采用mtDNA 细胞色素b (Cyt b ) 基因序列分析技术, 分析了黄海南部及东海银鲳群体的遗传结构, 旨在为银鲳资源的合理管理和保护提供参考。 1 材料与方法 1.1 实验材料 银鲳样品为2021年5月—2021年9月采集于江苏连云港(N34°48′, E119°48′) 、江苏吕四(N32°54′, E121°27′) 、浙江舟山(N30°14′, E122°10′) 、浙江洞头(N28°1′, E121°7′) 、福建霞浦(N26°42′, E119°58′) 和福建东山(N24°8′, E117°55′) 近海6个采集点(图1), 以下依次简称为LYG 、LS 、ZS 、DT 、XP 和DS 群体。除LYG 和DS 群体样本数分别为15和21尾外, 其他群体均为20尾, 共计116个样品。样品采集后取背部肌肉组织于95%乙醇中保存备用。 1.2 序列测定 取背部肌肉约100 mg, 按照酚-氯仿法提取基DNA 用1%的琼脂糖凝胶电泳检测后 因组DNA [10]。 收稿日期: 2021-06-22; 修订日期: 2021-04-12 基金项目: 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金（东海水产研究所2021Z02）资助 作者简介: 赵峰(1978—), 男, 山东德州人; 博士; 主要从事水产动物种质资源与生态生理学研究。E-mail: drzhaofeng@ 通讯作者: 庄平, E-mail: pzhuang@ 746 水生生物学报 35卷 软件确定单倍型。单倍