《pbs作业管理系统》ppt模板课件.ppt

Server端的动态设置 PBS要能正常运行还需要通过qmgr命令的server进行配置，设置一些属性。输入qmgr命令进入配置交互命令。下面是让PBS可以正常运行的一些步骤。 * * qmgr命令（管理员使用） 输入qmgr进入交互式模式后即可输入各种命令 qmgr动作： 对象类型和操作符 * * PBS队列设置 导入server配置文件： [root@node1 root]# qmgr queue.conf 输出配置文件： [root@node1 root]# qmgr –c “print server” queue.conf 配置文件例子： * * Scheduler调度行为配置 Scheduler的行为由配置目录下的sched_priv/sched_config文件进行控制 Sort_by关键字控制调度算法可以选择的选项为 no_sort ，shortest_job_first，longest_job_first ，smallest_memory_first，largest_memory_first，high_priority_first，low_priority_first，multi_sort，fair_share，large_walltime_first，short_walltime_first 修改这个文件后重新启动scheduler即可。 * * 内 容 任务管理系统概述 PBS作业调度系统 作业调度系统的使用 * * PBS的使用步骤 准备：编写描述改作业的脚本，包括作业名，需要的资源等。 提交：使用qsub命令将该作业提交给PBS服务器 排队：服务器将该任务排入适当的队列 调度：服务器检查各工作节点的状态是否符合该作业的要求，并进行调度。 执行：当条件满足时，作业被发给相应的执行服务器执行。程序运行时执行服务器会收集程序的标准输出和标准错误流，等程序结束时，将这些信息返回给用户。 查询和调整：当作业在运行时，用户可以使用qstat进行状态查询。用户发现作业提交错误时，可以使用qdel删除正在运行的作业。 查看结果：使用文本编辑软件vi或者系统命令cat, less等查看输出及错误信息显示。 * * PBS 的基本命令 在PBS系统中，用户使用qsub 命令提交用户程序。用户运行程序的命令及PBS环境变量设置组成PBS作业脚本，作业脚本使用如下格式提交到PBS系统运行： * * qsub运行参数 * * PBS 作业脚本 注释,以“#”开头 PBS指令,以“#PBS”开头 SHELL命令 * * PBS的环境变量 * * PBS 作业脚本 注释,以“#”开头 PBS指令,以“#PBS”开头 SHELL命令 * * PBS 作业脚本举例 * * 详细示例 编辑PBS脚本内容如下：（注意，#PBS行不是注释，所有说明行均以###开始，即红色字体部分） ###声明作业名为mpi #PBS -N mpi ###申请资源数为10个节点，每个节点16个cpu #PBS -l nodes=10:ppn=16 ###将标准输出信息与标准错误信息合并输出到文件中 #PBS -j oe ###指定作业提交到low队列 #PBS –q low ###估计最大运算时间为1000小时，若没有设置这项，系统为自动按所在队列默认walltime处理 #PBS -l walltime=1000:00:00 * * ###在作业结束时，给用户发邮件 #PBS -m e ###声明邮箱地址，如test@ #PBS -M test@ ###进入作业调度目录 cd $PBS_O_WORKDIR ###计算申请的cpu数目 NP=`cat $PBS_NODEFILE | wc -l` ###设置计算所需要的环境变量，如使用GNU版OpenMPI运行程序 source /public/software/mpi/openmpi1.4-gnu.sh ###程序运行部分，使用infiniband网运行此程序 mpirun -np $NP -machinefile $PBS_NODE btl self,openib cpi-openmpi * * 一个复杂的PBS作业脚本 * * 查询和取消作业 * * 查询作业运行的位置 * * ansys 单节点计算 ansys110 -np 4 -i wing.inp 跨节点计算： ansys110 -dis -machines node22:4:node23:4 -i wing.inp * * ansys.pbs #!/bin/bash #PBS -N ansys_wing #PBS