蛋白质结构与功能的生物信息学研究.docVIP

可修改 欢迎下载 精品 Word 可修改 欢迎下载 精品 Word 可修改 欢迎下载 精品 Word 实验名称：蛋白质结构与功能的生物信息学研究 实验目的：1.掌握运用BLAST工具对指定蛋白质的氨基酸序列同源性搜索的方法。 2.掌握用不同的工具分析蛋白质的氨基酸序列的基本性质 3掌握蛋白质的氨基酸序列进行三维结构的分析 4.熟悉对蛋白质的氨基酸序列所代表蛋白的修饰情况、所参与的代谢途径、相互作用的蛋白，以及与疾病的相关性的分析。 实验方法和流程： 同源性搜索 同源性从分子水平讲则是指两个 核酸分子的 核苷酸序列或两个蛋白质分子的氨基酸序列间的相似程度。BLAST工具能对生物不同蛋白质的氨基酸序列或不同的基因的DNA序列极性比对，并从相应数据库中找到相同或相似序列。对指定的蛋白质的氨基酸序列进行同源性搜索步骤如下： ↓ 登录网址/blast/ ↓ 输入序列后,运行blast工具 ↓ 序列比对的图形结果显示 序列比对的图形结果：用相似性区段（Hit）覆盖输入序列的范围判断两个序列的相似性。如果图形中包含低得分的颜色（主要是红色）区段，表明两序列的并非完全匹配。 ↓ 匹配序列列表及得分 可选择不同的比对工具各序列得分 可选择不同的比对工具 各序列得分 备注: Clusta