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代谢工程导读; 研究代谢工程的就是为了能精确地处理好微生物细胞自身的利益与人类对微生物细胞提出的要求之间的对立与统一的关系。;代谢工程的导读;; 用代谢途径操作的手段来改造微生物以获得期望的性质,这确实并不是新的观念。在氨基酸、抗生素、溶剂和维生素的发酵法生产中,都可以找到采用这个路子实现人类理想的一些突出的例子。这些方法主要依赖于用化学诱变剂处理微生物,并用进行设计的筛选技术来检出已获得优良性状的突变株。尽管这种方法已被广泛地接受并已取得??的效果,但人们对突变株的遗传和代谢性状的精确变化,知之甚少。; ; 有人把这样的做法叫做“逆行的代谢工程”(reverse metabolic engineering), “逆行的代谢工程” 为代谢网络的构建和完善,以及代谢工程的进展提供了大量的生理学和遗传学信息。;;; 这种分析方法的基础是拟稳态假设,即假设在产物形成速率最大的阶段各种代谢中间物的胞内浓度变化速率为零。根据质量平衡,由 n 个中间代谢物即可得到 n 个关于速率的方程,通过测定胞外代谢产物的浓度,计算未知途径的流量。;;; ; ; ; 因为代谢工程借助于 DNA 重组技术而作为一种启用技术而出现,所以一开始人们就把注意力放在这个领域的综合方面:新的基因在不同寄主中的表达,内酶的扩增,基因的删除,酶活力修饰,转录的解调或酶的解调等。; ; 与所有传统的工程领域一样,代谢工程也包含 “ 分析 ” 和 “ 综合 ” 两个规定的步骤。;;;; ; ; 通过对整个反应体系而不是一个个孤立的反应的考察就有可能获得关于代谢和细胞功能的更全面的认识,在这个的意义上 “ 代谢网络 ” 的观念是最为重要的。; ; 代谢工程让人们把注意力转向代谢网络的整个体系而不是其组成部分。这个转向说明基因工程已在总结经验和教训中走向成熟。; 代谢工程把发酵工程的两个关键的组成部分菌种和发酵工艺控制凝聚在一起,这正是发酵原理的基本立场。在发酵工业的历史上菌种和发酵工艺控制的分开,促进了发酵生产的工业化,也束缚了高精度发酵工程的发展。代谢工程使发酵工程返朴归真,代谢工程是强化了生物学属性的广义的发酵工程。; 发酵原理(工业发酵的生物学原理)是代谢控制发酵通向代谢工程的桥梁,是分子生物学技术在发酵工业上取得丰硕成果的向导,也是我国生物工程、发酵工程界后生超越前辈、领先世界的“内功”。;; 几十年来我们一直是用物理或化学诱变来改变微生物的遗传特性。通过传统的诱变和筛选,成功开发了大量的生产抗生素和氨基酸的菌种。在已知代谢途径的基础上,采用了一些精心设计的筛选方法,但是整体上这个方法还仅仅是一种 “ 试差法 ” 。; DNA 重组技术的出现使人类的许多美好理想有可能成为现实。用目标明确的遗传修饰替代传统的暗箱操作去改变代谢途径,已取得可喜的成绩。发酵工程和微生物代谢流的分析提供的信息,又可以校正遗传修饰的精度,从而更进一步逼近预定目标。; 代谢工程最初被定义为:用 DNA 重组技术修饰特定的生化反应或引进新的生化反应,直接改善产物的形成和细胞的性能的学科。 ; 这样定义的代谢工程的基本特征是工作目标的确切性。也就是说,先要找到要进行修饰或要引进的目标生化反应,一旦找准了目标,就用已建立的分子生物学技术去扩增、去抑制或删除、去传递相应的基因或酶,或者解除对相应的基因或酶调节,而广义的DNA重组只是常规地应用于不同步骤中,以便于达到这些目标。; 也有人这样给代谢工程下定义:通过使用 DNA 重组和分子生物学技术,对代谢途径进行修饰和(或)引进缺失,从而改变细胞的新陈代谢作用和(或)细胞特性的生物工程的分支。这样的定义尽管强调了代谢工程目标的确切性,但仍不能包容代谢工程的工程分析方面的内容,仍不能做到 “分析”和“综合”的有机结合。 ; 应该根据代谢工程的生物学和工程学实质来规范代谢工程的内涵,给代谢工程下定义。;代谢工程的定义: 把量化代谢流及其控制的工程分析方法与根据分析结果制定的遗传修饰方案付之实施的分子生物学技术结合起来,以反复分析、校验和修正的方式进行实际操作,改善微生物的产物形成的能力和微生物的细胞性能,从而满足人类对生物的特定需求的生物工程的分支。;;⑥ 研究和完善微生物代谢及代谢调节的知识,⑦ 生物制药方面的应用,⑧ 环境净化方面的应用,⑨ 酶制剂、微生物多肽制品的进一
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