《相互作用与分子识别》ppt教案模板.pptVIP

Add the author and the accompanying title;第一节 生物分子间的识别;（一）分子或亚基的聚合;胰岛素浓度越大，高聚体的数量越多。 （二）形成聚合体的主要结合力 ⒈疏水作用 在胰岛素单体的B链上，由Val12、Tyr16、Phe24、Phe25和Tyr26的疏水侧链形成一个疏水面，两个疏水面可结合成一个疏水核。 ⒉氢键 研究表明，胰岛素B链C末端肽段是伸展构象;在两个C末端肽段之间，一方的Phe24的N—H和 C=O基分别与另一方的Tyr26 的C=O和N—H基形成二个氢键；一方的Tyr26的N—H和C=O基分别与另一方的Phe24的C=O和N—H基形成二个??键。结果形成反平行β-折叠片。 酶水解除去B链C端5肽，胰岛素仍保持生物学活性，却不能聚合。这说明，上述反平行β-折叠片是稳定二聚体的重要因素。;（三）蛋白质分子或亚基的聚合方式 以不同方式聚合，形成聚合体。 ⒈线性聚合 特点：聚合体呈线性，聚合度非常大。 蛋白质的生理功能与线性聚合有关，例如杆状的血纤维蛋白质分子按末端对末端的方式直接聚合，生成细长的聚合体，同时也侧向聚集，以增加纤维蛋白的厚度，导致血液凝固。 ;;⒉环状聚合聚合形成环状，有环对称性;⒊螺旋聚合体 聚合体呈螺旋状，例如 烟草花叶病毒的壳体蛋白，每圈16.3个亚基，每个亚基分子量13.500，螺距2.5nm，长度300nm，由2130个亚基组成。 ;肌肉的F-肌动蛋白是双股螺旋， 每圈含13个单体，螺距70nm，单体呈球状。;⒋球状聚合体 由许多球状亚基相互聚合组成空心的球体 蛋白质分子或亚基之间的聚合有一定基础，即聚合部位一定是互补的； 在聚合时，为了达到一定程度的互补，还要发生单体之间的构象变化（类似与酶与底物相互作用）。 许多蛋白质的生物学功能与其聚合或解离关系密切。 ;;例如，鸡肝乙酰CoA羧化酶单体无催化活性，分子量410,000。加入柠檬酸或磷酸，可引起单体聚合，生成有催化活性的多聚体，分子量4～10×106 若除去活化剂，加入丙二酰CoA或软酯酰CoA，则引起该酶解聚，丧失活力。 ;;（四）分子识别的物理基础;细胞内发生化学反应的速率极快，一个酶分子平均每秒可催化1000次反应，分子运动须十分迅速才能满足。 分子的运动分为三类，即移动运动（从一个位置移动到另一位置）；振动（共价连接的原子相对另一原子的快速往复运动）；旋转。 快速分光技术发现：球蛋白每秒绕其轴心作大约106次翻滚和旋转（实际是构象变化）。 运动导致的扩散碰撞速率与扩散分子的浓度成正比。;⒉分子识别的动力学;结合速率=Kon[A][B]，解离速率=Koff[AB]。达到平衡时，两者相等，所以 Keq为平衡常数，又称亲和常数。亲和常数与结合力反相关，生物体系的亲和常数一般在103-1012mol/L之间，对应的结合能在17-71KJ/mol，大约有4-17个氢键。 ;⒊分子识别的特征;通过DNA-蛋白质相互作用分析，发现了多种结合特异DNA序列的蛋白质结构单元，最常见的是锌指结构，它存在于调节蛋白、DNA和RNA结合蛋白中。 锌指结构指至少由三个以上不同结构的、由锌离子稳定的、超小结构域组成的蛋白质单元，该单元与DNA的大沟主要通过三个碱基对作用，而锌指结构的连接区则悬于大沟之上，不直接参与与DNA的结合。 ;;;;（四）分子识别过程中的高级结构变化;（五）分子识别过程的连续和协调性;肾上腺素调节糖代谢的过程;;第二节 分子识别的化学基础;（一）相互作用的化学键;⒈共价键结合;⒉离子键;⒊离子-偶极和偶极-偶极相互作用;这些电荷分布不均匀的基团，可以与带相反电荷的基团形成相互作用，即偶极-离子相互作用；偶极-偶极间相互作用；前者比范德华力强，后者与范德华力相当。 这种作用常在药物与受体之间出现。例如局部麻醉药狄布卡因，解痉药阿托品和乙酰胆碱与各自的受体相互作用（后图）;⒋氢键相互作用;;生物体系中最常见的氢键发生在羟基（-OH）和氨基（-NH2)之间，其稳定性递减次序是： OHN＞OXO ＞NHN-NHO. 氢键既可以发生在分子间，也可以发生在分子内。 ;单个氢键较弱，多重氢键可大大增强稳定性。 氢键使DNA碱基配对，使蛋白质形成二级结构。蛋白质分子暴露的质子供-受体基团，可与药物分子的质子受-供体基团相互作用。 而药物上的-OH\-COOH\-CO-\-NH2和-SH基团，可通过氢键有效地与受体结合。 ;⒌芳香氢键(π平面氢键）;⒍电荷转移;⒎疏水相互作用;鸽肝二氢叶酸酶与碳氢化合物取代基杂环间的疏水作用;⒏范德华引力;⒐螯合作用;青霉胺与Cu的螯合物;8-羟基喹宁-Fe螯合物;（二）分子识别中的立体化学因素;几何异构体中官能团分布与受体药效基团排列相差极大，相互作用受到影响，理化和