并行版VASP安装指南.docVIP

并行版VASP安装指南 安装指南 第一版 2008年10月23日 并行版VASP安装指南 一、软件环境 操作系统:Redhat Enterprise Linux AS 4 update 4 编译器: Fortran Intel Fortron Complier 10.1.018 ia32 C/C++ Intel C/C++Complier 10.1.018 下载地址: 数学库: GotoBLAS 1.26 FFTW 3.1.2 下载地址: 并行环境: MPICH2 1.0.7 软件: Vasp 4.6 Vasp 4.lib 二、硬件环境 两台服务器，配置相同 主机名:node1 node2 IP地址: 三、安装方法 1、 操作系统的安装和配置 以下步骤如果不特别说明都是在两台机器上分别进行 常规安装，选择开发软件包，不需要选择服务器包软件。安装系统完成后，按照以 下步骤安装: 设置第一台机器的主机名为node1 修改/etc/sysconfig/network文件中第二行 HOSTNAME=node1 检查SSH和NFS服务软件是否安装 [root@node1 ~]# rpm -qa | grep ssh openssh-3.9p1-8.RHEL4.15 openssh-askpass-gnome-3.9p1-8.RHEL4.15 openssh-clients-3.9p1-8.RHEL4.15 openssh-server-3.9p1-8.RHEL4.15 openssh-askpass-3.9p1-8.RHEL4.15 # rpm -qa | grep nfs 修改/etc/hosts文件 增加以下几行 安装指南 第一版 2008年10月23日 node1 node2 使用主机名Ping一下，检查网络和主机名字是否配置正确 # ping node1 # ping node2 配置SSH互相信任关系 步骤省略 分别在两台机器上 运行 #ssh node1 #ssh node2 如果不输入密码就可以登录，说明配置成功 配置NFS服务器 步骤省略 本例把node1作为NFS服务器，共享/home/public 目录，node2挂载它到本机的/home/public目录 注意设置NFS共享目录为可读写 2、 编译器安装 解压编译器 #cd /home/soft #tar xvfz l_fc_p_10.1.018_ia32.tar.gz #cd l_fc_p_10.1.018_ia32 #./install.sh 中间需要输入编译器的序列号 我把它安装在了/usr/local/fc目录下 在/root/.bash_profile和/etc/profile文件的最后一行 增加 . /usr/local/fc/bin/ifortvars.sh 以便设置fortron编译器的环境变量 C编译器的安装与此类似 在/root/.bash_profile和/etc/profile文件的最后一行 增加 CXX=/usr/local/cc/bin/icpc ; export CXX CC=/usr/local/cc/bin/icc ; export CC 3、 并行库安装 #tar xvfz mpich2-1.0.7.tar.gz 解压mpichi2到mpich2-1.0.7 #cd mpich2-1.0.7 # ./configure --prefix=/usr/local/mpich2 -rsh=ssh --with-cflags=-O \ -f90=ifort -FR -lowercase --with-f77flags=-O --without-romio -fc=ifort #make #make install 增加环境变量 在/root/.bash_profile和/etc/profile文件的最后一行 增加 export PATH=$PATH:/usr/local/mpich2/bin 安装指南 第一版 2008年10月23日 export MPI_USEP4SSPORT=yes export MPI_P4SSPORT=22 export P4_RSHCOMMAND=ssh 测试环境变量设置 #which mpd #which mpicc #which mpiexec #which mpirun 修改/etc/mpd.conf文件，内容为secretword=myword #vi /etc/mpd.conf 设置文件读取权限和修改时间 #touch /etc