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(19)中华人民共和国国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号 CN 108018607 A
(43)申请公布日
2018.05.11
(21)申请号 201610962942.7
(22)申请日 2016.10.28
(71)申请人 深圳华大基因股份有限公司
地址 518083 广东省深圳市盐田区洪安三
街21号华大综合园7栋7层-14层
(72)发明人 刘舒 伍梓靖
(74)专利代理机构 深圳鼎合诚知识产权代理有
限公司 44281
代理人 孙银行 彭家恩
(51)Int.Cl.
C40B 20/04(2006.01)
C12Q 1/6869(2018.01)
权利要求书1页 说明书6页 附图2页
(54)发明名称
一种提升测序平台文库拆分率的标签序列
混库方法和装置
(57)摘要
本发明公开了一种提升测序平台文库拆分
率的标签序列混库方法和装置。所述方法包括:
将多个标签序列中每个位置的A、C碱基替换为同
一个符号,将G、T碱基替换为另一个符号,从而将
每个标签序列转换成由两种符号表示的序列;选
取标签序列转换后两两标签序列在大于2个位置
有差异的序列进行混库。本发明的方法对标签序
列的碱基作转化处理,并且设定两两混库的差异
标准,根据设置的标签序列混库组合规则,确保
标签序列测序成功率达到100%,标签序列的拆
分率达到90%以上。
A
7
0
6
8
1
0
8
0
1
N
C
CN 108018607 A 权 利 要 求 书 1/1页
1.一种提升测序平台文库拆分率的标签序列混库方法,其特征在于,所述方法包括:
将多个标签序列中每个位置的A、C碱基替换为同一个符号,将G、T碱基替换为另一个符
号,从而将每个标签序列转换成由两种符号表示的序列;
选取标签序列转换后两两标签序列在大于2个位置有差异的序列进行混库。
2.根据权利要求1所述的标签序列混库方法,其特征在于,将标签序列中每个位置的A、
C碱基替换为符号A,将G、T碱基替换为符号B。
3.根据权利要求1所述的标签序列混库方法,其特征在于,所述标签序列的长度是4-10
个碱基,优选6-8个碱基。
4.根据权利要求1所述的标签序列混库方法,其特征在于,选取二者转换后在≥4个位
置有差异的序列进行混库。
5.根据权利要求1-4任一项所述的标签序列混库方法,其特征在于,所述测序平台是
Illumina Hiseq/Miseq测序平台。
6.一种提升测序平台文库拆分率的标签序列混库装置,其特征在于,所述装置包括:
序列转换单元,用于将多个标签序列中每个位置的A、C碱基替换为同一个符号,将G、T
碱基替换为另一个符号,从而将每个标签序列转换成由两种符号表示的序列;
序列比对单元,用于选取标签序列转换后两两标签序列在大于2个位置有差异的序列
进行混库。
7.根据权利要求6所述的标签序列混库装置,其特征在于,将标签序列中每个位置的A、
C碱基替换为符号A,将G、T碱基替换为符号B。
8.根据权利要求6所述的标签序列混库装置,其特征在于,所述标签序列的长度是4-10
个碱基,优选6-8个碱基。
9.根据权利要求6所述的标签序列混库装置,其特征在于,选取二者转换后在≥4个位
置有差异的序列进行混库。
10.根据权利要求6-9任一项所述的标签序列混库装置,其特征在于,所述测序平台是
Illumina Hiseq/Miseq测序平台。
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