Freesurfer之感兴趣脑区映射及显示.docxVIP

FreeSUrfer之ROl映射步骤总结 前提条件： 】、完成UbUntU系统及FreeSUrfer软件的安装配責，熟悉使用Freeview; 2、 完成数据预处理，?t? recon-αll SUbjeCtS - all 及 recon-all SUbjeCtS -qcache; 3、 矢Q道基于 freesurfer 的几个 n∩Qtlob 函数用法：IOad-r∩gh, save-mgh7 read.QrlnotQtiOrL [voL Mz mr.parmsz volsz]二 IOad-mgh(f∩amezslicesjframesrheaderonly) save-mgh(voLfnamez M, r∩r-parms)z M is the 4x4 vox2ras transform [vertices, IabelZ COIOrtable] = GOCLQ∩∏OtcItiOn(filenome [f verbosity]) 4、 .mgh 及.rτιgz 是 freesurfer 使用的 MRl VOlUme 格式，类似于 NifTI,需用 IOoeLrngh 和 save-mgh函数打开读取或生成.mgh格式文件，从而在freesurfer上使用。 导入matlab函数 在freesurfer的安装路径下，有一个名为matlab的文件夹，里面有一些文件用于处理图像, 把这个文件夹及子文件夹添加到Matlab路径即可。另一种方法：在终端启动freesurfer,在这个环 境下运行matlab,也可以使用这些m文件（也就是IOQeLmgh等函数）。 averageblndocsF*datafsrastmat labBdfdmmSeSSlOnSCktOQ5IrCtrOi nAscgStotsLUTtxtAUTHORS average bln docs F* data fsrast mat lab Bdfd mm SeSSlOnS CktOQ5 IrCtrOi n AscgStotsLUTtxt AUTHORS 整理好被试数据，每一被试的所有数据分别在一个目录下（预处理后默认存放形式） ITIE Name ■ SiZC * ModIfted Il 10 items Folder Mdf 12 12 10 i?ms FOIder 12 r 13 10 items FOldeC MarI2 14 10 items FOIder Mar 12 用 15 10 ItemS FOlder Marl2 16 10 items FOIdef Mar 12 17 10 ItemS FOldef Mdf 12 13 10 items FOldef Mdr 12 19 10 items FoIdef Mdf 12 — r no IOitemS FOldef Mdt 12 r Iii 10 items Foldef Mdfl2 r 112 10 items FOldH Mdf 12 113 10 items FOIdef M? 12 114 10 items FOIdef 12 IlS IOlteml FOldef MMI2 116 IOitemf FOIdef Maf 12 117 10 items FOlder Mar 12 118 10 items FOlder Mar 12 119 10 items FOIdCr MdCl2 UO 10 items FQldCr MoC 12 Ul 10 items FOIder Mdr IZ RTLE Ndme ■ SiZe TyPe Modified F Γ1 IOitemS Folder Marl2 f2 IOitemS Folder MarI2 Γ3 IOitemS Folder MarlZ r4 IOitCmS FOIdCr MarI2 Γ5 IOitemS FoMer MarIZ F r6 IOitemS FOlder Marl2 r7 IOitemS FOldef NUrI2 Γ8 IOitemS FOIder MarI2 r9 IOitemS Folder MarI2 ? ? no IOitemS FOIder Marl2 ? rn IOitemS FOlder Marl2 ■■1 M2 IOitemS Folder MarIZ r13 IOitemS FOlder Marl2 r14 IOItemS FoIder Marl2 F r1S IOitemS Folder MarI2 r16 IOitemS FoIder MarI2 r17 IoitemS FOIder Mar 12 r18 IOitemS Folder MarI2 资料. 三、 统计同组所有被试皮层特征的均值： 所有基于顶点