一种统计DNA拷贝数信息的方法、装置及存储介质发明专利 (1).pdfVIP

一种统计DNA拷贝数信息的方法、装置及存储介质发明专利 (1).pdf

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(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利 (10)授权公告号 CN 109390039 B (45)授权公告日 2020.10.16 (21)申请号 201710685620.7 (51)Int.Cl. G16B 25/10 (2019.01) (22)申请日 2017.08.11 G16B 20/20 (2019.01) (65)同一申请的已公布的文献号 (56)对比文件 申请公布号 CN 109390039 A 余振华.基于下一代测序的肿瘤基因组拷贝 (43)申请公布日 2019.02.26 数变异检测算法研究.《中国博士学位论文全文 (73)专利权人 深圳华大基因股份有限公司 数据库医药卫生科技辑》.2017,(第2期),第 地址 518083 广东省深圳市盐田区洪安三 E072-36页. 街21号华大综合园7栋7层-14层 石文新.不同因素对早期胚胎线粒体DNA拷 贝数影响的研究.《中国优秀硕士学位论文全文 (72)发明人 金鑫 周亚峰 李佳 袁玉英  数据库医药卫生科技辑》.2017,(第3期),第 陈芳 刘强 刘娜 吴仁花  E068-68页. 张红云 茅矛 尹烨  审查员 李雯雯 (74)专利代理机构 深圳鼎合诚知识产权代理有 限公司 44281 代理人 孙银行 彭家恩 权利要求书2页 说明书8页 附图4页 (54)发明名称 一种统计DNA拷贝数信息的方法、装置及存 储介质 (57)摘要 一种统计DNA拷贝数信息的方法、装置及存 储介质。该方法包括:获取目标基因组的全基因 组测序读段数据;将所述测序读段数据比对到参 考基因组以去除未比对上的读段及重复读段;分 别计算基于排列组合的染色体非整倍性评估值 PECA和基于排列组合的单臂不稳定性评估值 PEAI;将所述PECA值和所述PEAI值分别与各自的 设定阈值比较以评估基因组拷贝数变化。本发明 结合PECA和PEAI值,分别从全基因组和染色体单 臂层面评估基因组拷贝数变化,能够大大降低测 序和后期生物信息学分析的成本。 B 9 3 0 0 9 3 9 0 1 N C CN 109390039 B 权 利 要 求 书 1/2页 1.一种统计DNA拷贝数信息的方法,其特征在于,包括: 获取目标基因组的全基因组测序读段数据,其中所述目标基因组作为测试样本基因 组,或者测试样本基因组和对照样本基因组的综合; 将所述测序读段数据比对到参考基因组以去除未比对上的读段及重复读段; 分别计算基于排列组合的染色体非整倍性评估值PECA和基于排列组合的单

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