实验十五、SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳
一、概述
蛋白质的聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)是蛋白质分析过程中最常用的技术,通常在电泳分离时,其迁移率主要取决于蛋白质本身所带的电荷多少、分子量大小和形态。但如在PAGE中加入阴离子去污剂SDS, SDS将蛋白质的二硫键、氢键及梳水键打开,使蛋白质变性, SDS将包裹在变性蛋白表面,使蛋白质成为刚性分子;同时,由于SDS带有大量负电荷,使蛋白质本身带有的电荷可忽略。至此情况下,不同蛋白质分子的迁移率主要决定于带有的SDS量,即蛋白质分子的大小。因此利用SDS可测定蛋白质的分子量。
二、试剂
丙烯酰胺和甲叉双丙烯酰胺单体溶液(Acr和Bis) 称取丙烯酰胺30g,甲叉双丙烯酰胺0.8g,加水至100ml,过滤后存于棕色瓶中,于4℃保存。
4X分离胶缓冲液 称取Tris 18.17g,加入10%SDS贮备液4ml,用12mol/L HCl调pH至8,8,定容至100ml。
4X浓缩胶缓冲液 称取Tris 6.06g,加入10%SDS 4ml,用l2mol/L HCI调pH至6.8,定容至100ml。
10%过硫酸铵 称取过硫酸铵0.5g,加水至5ml。本储存液应现配现用。
10X电极缓冲液 称取Tris 30g、甘氨酸144g,加入10%SDSl00ml,定容至1000ml。
2X样品缓冲液 称取蔗糖2g(或甘油2m1),加入10% SDS 2ml,溴酚蓝0.25mg,浓缩胶缓冲液2.5ml、β-巯基乙醇0.5ml,加水定容至10ml。
染色液 称取考马斯亮蓝R-250 2.5g,加入甲醇450ml,冰乙酸l00ml、水650ml。
脱色液 甲醇100ml,冰乙酸100ml,加水800m1.
三、操作步骤
1、分离胶的制备
(1). 根据所分离的蛋白质分子量选择分离胶的浓度,制备不同浓度的凝胶所需的储备液可参考下表,该配方可配制0.75mm厚、10cm X 7cm的凝胶。在配制凝胶时,将水、30%Acr和Bis储液、4X分离胶储液混合完全后,真空脱气5分钟,然后加入过硫酸胺和TEMED,立即准备灌制凝胶。
(2). 将混合液充分混合后,缓慢地倒入已经固定在夹心垂直平板电泳槽里的狭槽中,注意在本操作过程中不能产生任何气泡。然后尽快地在分离胶的上面轻轻地覆盖一层水。
(3). 置于室温下15-30分钟,使凝胶聚合完全 (在水相和凝胶的交界处有一明显的亮线)。除去上层水相,然后再用水或浓缩胶缓冲液(0.125mol/m1Tris-HCI,pH6.8, 0.1%SDS) 洗凝胶表面,准备灌制浓缩胶。
不同浓度凝胶的制备
成
份
不同浓度所需的储备液体积
8.5%
10%
12.5%
15%
17.5%
H20
30% Acr和Bis分离胶
4X缓冲液
10% 过硫酸铵
TEMED
3.5ml
2.0ml
l.9ml
112 u1
5 ul
3.1ml
2.4ml
1.9ml
112 ul
5 ul
2.5ml
3.Oml
1.9ml
112 ul
5 ul
1.8ml
3.7ml
1.9ml
112 ul
5 ul
1.2ml
4.3ml
1.9ml
112ul
5ul
2. 浓缩胶制备的方法
(1). 将丙烯酰胺和甲叉双丙烯酰胺单体储备液0.6ml,浓缩胶缓冲液888u1、水2ml、10%过硫酸铵56ul、TEMEDl0ul混合均匀后,立即灌胶。
(2). 将预先制备好的浓缩胶慢慢地灌进狭槽中, 然后将所需的样品梳(形成加样孔)插于夹心槽上部,并上下轻轻拉动梳子,小心地去除粘附在梳齿顶部的小气泡,待聚合完全后即可拔去梳子,准备电泳。
3. 样品制备及电泳
(1). 样品处理:蛋白质样品和分子量标准蛋白质在上样电泳前均需变性。通常是将样品蛋白质溶液与等体积的样品缓冲液混合后置于eppendorf管中,将混合物置于95-100℃加热5分钟,立即置于冰上,或于-20℃储存,以便再次分析时使用。
(2). 上样:样品制备好以后,即可上样电泳。先将样品梳子移去,用双蒸水淋洗每个样品孔,然后在样品孔中加入电泳缓冲液,同时在电泳槽中也加满电泳缓冲液。处理完毕后,根据实验的需要加样电泳。
(3). 电泳:通常使用稳流的方式进行电泳,电流一般为18mA,时间大约3-4小时。
4、凝胶的染色与脱色
电泳完毕后,倒去电泳缓冲液,取出夹心槽。小心地取出凝胶,置于染色液中染色4小时,并不时地轻轻晃动。染色完毕后,倒去染色液,用少量水淋洗凝胶,然后置于脱色液中脱色,并轻轻晃动,脱色至蓝色背景消失为止。此凝胶即可用于分析。
考马斯亮蓝检测灵敏度为0.3-1 ug/蛋白带。
银染检测灵敏度为0.1-1.0 ng/蛋白带,比考马斯亮蓝检测灵敏度高100
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