生物信息学序列格式.pptxVIP

序列格式数据注释FASTA格式（或Pearson格式）序列文件的第一行是由大于符号（＞）打头的任意文字说明，主要为标记序列用。从第二行开始是序列本身，标准核苷酸符号或氨基酸单字母符号。通常核苷酸符号大小写均可，而氨基酸一般用大写字母。文件中每一行都不要超过80个字符（通常60个字符）。核酸序列氨基酸序列剖析GenBank Flatfile从GenBank获取一条序列例如 序列编号为 L05934玉米过氧化氢酶3（maize cat3）剖析GenBank FlatfileGenBank flatfile格式可以分成3个部分：1）头部包含关于整个序列的信息（描述字符）；2）注释这一序列的特性（Feature Table ）；3）序列本身(Sequence)。注：所有的核苷酸数据库记录（EMBL/GenBank/DDBJ)都在最后　一行以//结尾。/EMBL和GenBank数据库格式EMBLGenBank含义IDLOCUS 序列简单说明DEDEFINITION序列名称ACACCESSION序列编号SVVERSION序列版本号KWKEYWORDS关键词OSSOURCE序列来源的物种名OCORGANISM序列来源的物种学名和分类地位RNREFERENCE相关文献编号，或递交序列的注册信息RAAUTHORS相关文献作者，或递交序列的作者RT TITLE相关文献题目RLJOURNAL相关文献刊物