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怎样用seqman 看测序结果 1 打开seqman 软件，点file ，点Ne ，点 。 2 弹出新的对话框，点击 。 找到测序文件所在文件夹，在文件类型中选中 ，选中四个测序结果 ，点“打开”，再点done 。 3 再点Assemble 。软件就会自动拼装序列。 。 4 ，加入我们已知的参考序列（就是NCBI 下下来的那个）。点菜单栏的sequence 中的Add One ，找到参考序列所在文件夹，单击它（这里我命名的叫Amplification product ），打开。就谈加了一个参考序列。 5，双击，弹出框框。 看到小灰色箭头了吗，每个都单击一下。就会出现以下详细资料。 的 反 后 向 端 测 序 参考序列 的 正 前 向 端 测 序 红色峰代表T，蓝色代表C，绿色代表A，黑色代表G 。 大部分的峰是清晰，比如这样的峰。但是有小部分的峰是不清楚的，比如这样的 峰。 清晰的峰可以判断这个碱基，但是不清晰的峰我们一般不判断，就省略过去， 因为不清晰的峰不大可信。 这里要提一点的是，华大小规模测序用的是SANGER法，这种方法有个弊端就 是靠近引物一端的大约20-50个碱基的峰图是可能不清楚，之后的才很清晰。 我说这个话，其实可以通过图里就能反映出来。注意看上面两个，第一个是 8 号PCR产物的反向测序，第二个是9号PCR产物的反向测序（就是由后引物那 边测过来的）。第三、第四个分别是8号、9号个体的正向测序。 那我们来看看反向测序的情况 前 反 端 向 测 序 的 参考序列 后 正 端 向 测 序 的 是否看到，反向测序的开头和之前正向测序的开头也一样呢？也是开始的地方不 清楚。这是必然的。 那个参考序列在中间。我们可以看到凡是能判断的序列，和参考序列是 99.99% 一致的。说明，我们扩增出来的PCR产物是可信的，就是预期的片段位置。