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- 2021-11-08 发布于江苏
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MapGene2Chrom 基于 Perl 和 SVG 语言绘制基因物理图谱
晁江涛,孔英珍,王倩,孙玉合,龚达平,吕婧,刘贯山
【摘 要】摘要:遗传图谱表现形式简洁明了,为分析遗传规律、克隆基因提供了便利。Gbrowse 、MapViewer 等工具虽然能够协助研究人员绘制相似形式的物理图谱,但有很大的局限性:(1)数据需提前布置好;(2)输出结果无法灵活修改。鉴于此,文章基于 Perl 和 SVG 语言,开发了一款生物辅助作图软件MapGene2Chrom 的本地版与网页版,该软件能够依据输入数据快速绘制相应的物理图谱。该软件输入数据格式简单,输出结果易于修改,图片格式为 SVG 矢量图,具有很好的移植性,以期为研究人员绘制物理图谱提供便利。
【期刊名称】遗传
【年(卷),期】2015(000)001
【总页数】7
【关键词】物理图谱;基因分布图;SVG 矢量图;作图;生物软件
依据分子标记之间的遗传距离绘制一张简洁、美观、大方的遗传图谱,为研究人员分析某一性状的遗传规律及图位克隆基因提供了便利。目前能够绘制遗传图谱的软件有 4 种: MAPMAKER[1] ,JoinMap[2 ~4],Mapplotter[5] 和MapDraw[6] 。前两种软件均具备计算遗传距离和绘制连锁图谱的功能,其中MAPMAKER 侧重于 Mac OS 平台;JoinMap 更侧重于 Windo
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