5-共线性分析完整可编辑版.pptxVIP

基因共线性分析共线性定义在生物学中共线性指的是遗传学中的基因连锁关系；最初， 共线性是用来描述同一染色体上的基因位置关系， 但现在更多的是指由同一祖先型分化而来的，不同物种间基因的类型及相对顺序的保守性。共线性片段的大小与物种之间的分化时间有很大关系： 分化时间较短的物种间， 积累的变异较少， 会保留更多从祖先遗传下来的特征； 而分化时间较长的物种间由于变异的积累导致共有的特征变少， 反而获得较短的共线性片段．共线性定义3.共线性主要强调两方面：一是基因的同源性； 另一就是基因的排列顺序．具体而言，同源又分２种： 直 系 同 源 和 旁 系 同 源．其 中 直 系 同 源 基 因指存在于祖先基因组中， 随后因为物种分化， 分别传递到不同的物种中， 这些基因往往在结构和功能上有很高的相似性． 旁系同源基因 ， 指同一基因组中由于基因复制而产生的同源基因．由于复制产生的同源基因， 没有相同的选择压力作用， 因此容易发生一些变异， 从而可能出现功能变异．共线性定义而共线性是物种间的一种关系， 所以其涉及的同源关系主要指直系同源关系， 但是由于旁系同源基因的存在， 往往会给共线性片段的识别增加很大的难度． 基因的排列顺序， 指各基因在染色体上的排列位置． 近缘物种分化距离很短， 基因丢失、 插入以及倒位、 转座等事件较少， 所以大部分基因都维持了祖先基因的相对排列顺序．因此， 近缘物种间Ｄ