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1;;1.基本原理 ;;;;;(4)凝胶电泳的分辨力与凝胶的类型和密度相关
一、凝胶类型
1.琼脂糖凝胶的分辨力在~50Kb之间(<20kb);可区分相差loobp的DNA片段,
常用水平装置在强度和方向恒定的电场下电泳。
2. 聚丙烯酰胺凝胶用于分离5-500bp的片段;垂直装置进行电泳
效果好、分辨率极高,相差1bp的DNA片断就能分开,能容纳相对大量的DNA
用于核苷酸多态性的分析
;不同浓度琼脂糖的凝胶分离范围;;2.影响DNA在凝胶中迁移速率的因素: ;;;;;;;3.琼脂糖凝胶电泳;;;;;;(2)琼脂糖凝胶中DNA的检测;凝胶的EB染色; (3)EB使用时的配制、贮存及使用
EB常用水配制成10 mg/ml的贮存液,于室温保存在棕色瓶或用铝箔包裹的瓶中,使用终浓度为0.5 μg/ml 。
(4)当要知道DNA片段准确大小时,凝胶应在无EB情况下电泳,电泳结束后再用EB染色。
;EB替代品;;;(3)结果分析;琼脂糖凝胶电泳检测细胞凋亡过程中
DNA Ladder的形成;;4.注意事项;5.常见问题与对策;;;;浓度和纯度的测定;(2)分光光度法
DNA或RNA链上碱基的苯环结构在紫光区具有较强吸收,其吸收峰在260nm处。
波长为260nm时,DNA或RNA的光密度OD260不仅与总含量有关,也随构型而有差异。
对标准样品来说,浓度为1μg / ml时,DNA钠盐的OD260=
当OD260=1时,dsDNA浓度约为50μg / ml
?????????????? ssDNA浓度约为37μg / ml
?????????????? RNA浓度约为40μg / ml
?????????????? 寡核苷酸浓度约为30μg / ml(由于底物不同有差异;;;操作步骤
1、? UV-240紫外分光光度计开机预热10min.
2、? 用重蒸水洗涤比色皿,吸水纸吸干,加入TE缓冲液后,放入样品室的S池架上,关上盖板。
3、? 设定狭缝后校零。
4、? 将标准样品和待测样品适当稀释(DNA5μl或RNA4μl用TE缓冲液稀释至1000μl)后,记录编号和稀释度。
5、? 把装有标准样品或待测样品的比色皿放进样品室的S架上,关闭盖板。
6、? 设定紫外光波长,分别测定230nm、260nm、280nm波长时的OD值。
7、? 计算待测样品的浓度与纯度。
DNA样品的浓度(μg / μl):OD260×稀释倍数×50/1000
RNA样品的浓度(μg / μl):OD260×稀释倍数×40/1000;; 基本过程同DNA电泳一样,但应明确一点的是,因为RNA分子对RNA酶的作用非常敏感,因此必须用对RNA酶有抑制作用DEPC水来配置所有溶液,所有与RNA接触的仪器和装置都要严格处理以尽量减少RNA酶对样品的降解;另外,因为RNA分子有二、三级结构可以影响其电泳结果,因此电泳时应在变性剂存在下进行,常用的变性剂为甲醛和戊二醛。 ;;1.基本原理 ;;;;;3.琼脂糖凝胶电泳;(2)分光光度法
DNA或RNA链上碱基的苯环结构在紫光区具有较强吸收,其吸收峰在260nm处。
波长为260nm时,DNA或RNA的光密度OD260不仅与总含量有关,也随构型而有差异。
对标准样品来说,浓度为1μg / ml时,DNA钠盐的OD260=
当OD260=1时,dsDNA浓度约为50μg / ml
?????????????? ssDNA浓度约为37μg / ml
?????????????? RNA浓度约为40μg / ml
?????????????? 寡核苷酸浓度约为30μg / ml(由于底物不同有差异;操作步骤
1、? UV-240紫外分光光度计开机预热10min.
2、? 用重蒸水洗涤比色皿,吸水纸吸干,加入TE缓冲液后,放入样品室的S池架上,关上盖板。
3、? 设定狭缝后校零。
4、? 将标准样品和待测样品适当稀释(DNA5μl或RNA4μl用TE缓冲液稀释至1000μl)后,记录编号和稀释度。
5、? 把装有标准样品或待测样品的比色皿放进样品室的S架上,关闭盖板。
6、? 设定紫外光波长,分别测定230nm、260nm、280nm波长时的OD值。
7、? 计算待测样品的浓度与纯度。
DNA样品的浓度(μg / μl):OD260×稀释倍数×50/1000
RNA样品的浓度(μg / μl):OD260×稀释倍数×40/1000;感谢您的观看。
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