单晶结构解析步骤.docxVIP

— PAGE \* Arabic 1 — 单晶结构解析步骤 shelxtl  open new  name  xp  fmol  kill $q  proj  select the good direction  exit  telp 0 -30  plotfile enter file name  draw file name  select file(ps file)  black and white  cell  fmol  kill $q  matr 1=a 2=b 3=c  pbox 5 15  pack  select (space=keep, enter=del) fmol  telp cell  enter file name  draw file name  select file type(a=psfile) black and white(enter)  plane  xp  read file name  fmol  mpln atom1 atom 2  enter  angle  xp  read file name  fmol  mpla n(atom number) atom1 atom 2  mpla n(atom number) atom1 atom 2  mpla n(atom number) atom1 atom 2  enter  fmol  kill  link  matr  pbox  pack  undo c**? C**?  telp cell  xl 计算方法  在ins中任何地方插入  mpla 虚拟平面的原子个数（例如六个原子只有四个可能共平面，即输入4），后面连续输入可能共平面的4个原子，后面在输入其他两个平面外的原子。  例如c1 c2 c3 c4 c5 n1中，c1 c2 c4 c5 共平面  mpla 4 c1 c2 c4 c5 c3 n1  txt  运行xcif  选择t  两次回车  输入文件名.txt  选择def  回车直到选择q  理论加氢  在ins中输入  HFIX 要加氢的原子  保存ins  运行XL  打开RES  拷贝相应的数据到ins中即可。  CHEMICAL DRAW  选中画笔  点出两个点  按ESC  点选择键  选中画笔  鼠标移动至出现小手  拖动到其他角度。  氢键数据的列出  eqiv $1 x, y, z(对称操作）  htab c12 o2_$1(形成氢键的两个重原子）  运行XL命令  在cif和1st文件中即有相关的数据  对称操作的寻找  XP中  cell中扫描NON-B  找到形成氢键的两个重原子  在钻石中找到相应的角  例如C12-H12...O2的角度中的对称操作就是  如有多个氢键  请输入$1, $2  解析晶体结构的方法  打开shelxtl  选择new  选择路径  选择raw文件  输入你的文件名（随便）  运行xprep  多个回车键  输入分子式（不知道的输入可能的原子类型）  输入另外一个全新的文件名（例如test，将产生test.ins文件) 询问是否保存新的hkl文件  输入y  回车  上述步骤产生test.ins  选择new  选择路径  选择刚产生的test.hkl文件  运行xs  程序自动调入test.ins文件  如在黑色屏幕的最下行显示re1）和键长，命名为X’，除去所有的Q峰，保存文件。  2、修改ins文件，将X和X‘的原子的占有率先定为10.500000  3、相应的氢的占有率先定为10.500000  4、运行XL和精修到收敛，打开CIF，观察X和X‘的热参数值，如X大，则降低其占有  率