分子对接方法.pptVIP

* * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * （一） 配体对CDK2，CDK4激酶选择性的研究 细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶（cyclin-dependent kinases, CDKs）是一类Ser/Thr 蛋白激酶，直接参与调控细胞分裂周期，顾名思义，CDK只在周期蛋白Cyclin活化下才能工作. 现在已经发现了13种CDK蛋白激酶和25种周期蛋白Cyclin，但它们具体的生物功能还不十分明了。其中CDK2、CDK5、CDK6已经解析出晶体结构，但CDKs的一级序列存在高的同源性，它们之间一级序列的高同源性暗示了三维结构的相似性 CDK1、CDK2、CDK4、CDK6是基于CDKs结构化学治疗癌症的主要靶标。至今为止，文献报告的CDKs抑制剂有多种 * 第六十三页，共90页 尽管化合物结构各异，但所有CDKs的小分子抑制剂有一些共同的特点： （1）一般小的分子量 （600）; （2） 平面、疏水性的多环化合物； （3）主要通过和ATP竞争来占据酶的ATP结合口袋； （4）主要通过疏水和氢键作用和酶结合； （5）配体与CDK2作用时，一般与Leu83和Glu81形成氢键。 * 第