关于生物信息学复习题.pdfVIP

名词解释 1..生物信息学 : 是研究生物信息的采集、处理、存储、传播，分析和解释等各方面的学科，也是随着 和的迅猛发展，生命科学和计算机科学相结合形成的一门新学科。 2.二级数据库：在一级数据库、实验数据和理论分析的基础上针对特定目标衍生而来，是对 生物学知识和信息的进一步的整理。 3.FASTA 序列格式：是将DNA 或者蛋白质序列表示为一个带有一些标记的核苷酸或者氨基酸字符串，大 于号（）表示一个新文件的开始，其他无特殊要求。 4.genbank 序列格式：是GenBank 数据库的基本信息单位，是最为广泛的生物信息学序列格式之一。该 文件格式按域划分为 4 个部分：第一部分包含整个记录的信息（描述符）；第二部分包含注释；第三部 分是引文区，提供了这个记录的科学依据；第四部分是核苷酸序列本身，以“//”结尾。 5.Entrez 检索系统：是NCBI 开发的核心检索系统，集成了NCBI 的各种数据库，具有链接的数据库多， 使用方便，能够进行交叉索引等特点。 6.BLAST：基本局部比对搜索工具，用于相似性搜索的工具，对需要进行检索的序列与数据 库中的每个序列做相似性比较。P94 7.查询序列（query sequence）：也称被检索序列，用来在数据库中检索并进行相似性比较 的序列。P98 8.打分矩阵（scoring matrix）：在相似性