生物芯片研究与应用200911tiling array and exon.pptxVIP

Tiling array and exon array;Tiling芯片;genome tiling探针来源;芯片上的双链形态对杂交的影响 难以规模化，制备 ~1-kb PCR 产物的tiling芯片仅以chromosome 22 (roughly 1% of the human genome)为例就需要 20 000 次PCR反应。 A PCR tiling of the entire human genome would require approximately two million PCR reactions at the same resolution。不仅PCR反应量大，而且相应的生物信息学处理要求也很大。 分辨率低;GeneChip Tiling Arrays feature;一般采用等长移位法，按照靶序列从头到尾选取一定长度（16－25nt－36nt）的互补核苷酸序列形成一组探针组合，其中相邻???针序列相差一个或多个碱基，覆盖的碱基数目是恒定的。 ;Tiling Array Design;Tiling Array Design;Promoter tiling array;Whole-Genome Tiling Array Sets;2004 science;Results;Chromatin Immunoprecipitation;Gene regulatio