理学基因芯片技术.pptxVIP

会计学;遗传信息迅猛增长 　　随着人类基因组（测序）计划（Human genome project）的逐步实施以及分子生物学相关学科的迅猛发展，越来越多的动植物、微生物基因组序列得以测定，基因序列数据正在以前所未有的速度迅速增长。;　　人类基因组（测序）计划（Human genome project）的逐步实施，现（1997年底）已完成2%序列及800，000个cDNA片段(EST)的测序工作，2008年已全部完成； 　　其它生物基因组的测定工作：11种微生物0.6-4.2Mb、大肠杆菌4.6Mb、酵母13Mb全序列，线虫71%、果蝇6%、小鼠0.2%序列得到测定。;　???然而，怎样去研究如此众多基因的生物信息及其在生命过程中所担负的功能，成了全世界生命科学工作者共同的课题！为此，建立新型杂交和测序方法以对大量的遗传信息进行高效、快速的检测、分析就显得格外重要了。;第七章 基因芯片技术;　　何谓基因芯片？芯片的种类有哪些？如何制作基因芯片？……　　;生物芯片的简介 生物芯片的分类 基因芯片制作 基因芯片的杂交及结果分析 基因芯片的应用;第一节　生物芯片简介 ;生物芯片（Biochip） 　　指通过机器人自动印迹或光引导化学合成技术在硅片、玻璃、凝胶或尼龙膜上制造的生物分子微阵列，根据分子间的特异性相互作用的原理，将生命科学领域中不连续的分析过程集成于芯片表面，以实现对细胞、蛋白质、基因及其它生物组分的准确、快速、大信息量的检测。;DNA芯片 蛋白质芯片 细胞芯片 组织芯片 多糖芯片 神经元芯片 等等;生物芯片包括： DNA芯片 蛋白质芯片 其它芯片;DNA芯片技术是指在固相支持物上原位合成（in situ synthesis）寡核苷酸探针，或者直接将大量的DNA探针以显微打印的方式有序的固化于支持物表面，然后与标记的样品杂交，通过对杂交信号的检测分析即可得出样品的遗传信息（基因序列及表达的信息）。;基因芯片指对数以千记的DNA片段同时进行处理分析的技术，诸如基因组DNA突变谱和mRNA表达谱的检测等（Trends in Biotechnology)。 　　该技术系指将大量探针分子固定于支持物上后与标记的样品分子进行杂交，通过检测每个探针分子的杂交信号强度进而获取样品分子的数量和序列信息。;基因芯片分析的过程： 　　样品及其标记处理、芯片的制作、分子杂交、信号的检测和数据处理及分析等几个步骤。;原理 -- 通过杂交检测信息;;第16页/共73页;　　早在八十年代初有人就曾设想利用计算机半导体技术生产基因芯片以对人类基因组大量的遗传信息进行分析和检查，但直到光引导原位合成(light-directed in situ synthesis)高密度探针技术和激光共聚焦显微扫描问世之后才使该设想逐步成为现实，并迅速应用到分子生物学的多个领域，得到了科学界的高度重视。;1989 年英国牛津大学的 Southern 等取得了在刚性载体表面固定寡聚核苷酸及杂交法测序的专利；与此同时俄罗斯和美国的科学家也提出了运用杂交法测定核酸序列（SBH）的设想。 1994 年研制出了一种基因芯片并用于检测 β-地中海贫血病的基因突变，筛选了一百多个 β-地中海贫血病已知的突变基因。;基因芯片发展历史;1995 年，一些国际大公司与研究机构合作共同开发具有商业价值的生物芯片及其相关的分析技术。 1997 年世界上第一张全基因组基因芯片——含有 6116 个基因的酵母全基因组芯片在斯坦福大学 Brown 实验室完成。从而使基因芯片技术在世界上快速得到应用。;基因芯片技术的特点的核心是微型化 　　芯片每平方厘米固体表面上可固定十万个 DNA 片段、数万个基因。一次分析可得到数万个基因的表达信息。微型化的另一方面是样品用量与试剂用量的微量化，用纳克级的 mRNA 、微升级的杂交液就能分析成千上万个基因的表达信息。这些都是其它研究技术所无法比拟的。 ;将样品中的DNA/RNA表上荧光标记，则可以定量检验基因的表达水平;?芯片制作及分析过程易于自动化 　　芯片设计制作可实现自动化，可根据要求将需要分析的基因制作成符合要求的芯片；杂交、洗片等过程都可实现自动化，工作效率大幅提高。 ;　　技术操作简单 　　自动化程高 　　序列数量大 　　检测效率高 　　应用范围广 　　成本相对低　; 高度集成化 大通量平行分析 大规模 高灵敏度 样品需要量小;第二节　生物芯片的分类;　　基因芯片以其片基(substrate)的不同可以分为无机片基和有机合成物片基。 　　前者主要包括半导体硅片和玻璃片，其上的探针主要以原位聚合的方法合成，后者主要有特定孔径的硝酸纤维膜和尼龙膜，其上的探针主要是预先合成后通过特殊的微量点样装置或仪器滴加到片基上去（如下表所示）。;基因芯片的