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生物学软件大全 1. 三维分子类 RASMOL :观看生物分子 3D 微观立体结构 RasTop:为 RasMol 2.7.1 的图形用户界面软件 CHIME :直接在浏览器中观看 3D 分子 MolMol : 将 pdb 等格式的蛋白文件通过微调, 存成普通的图 形文件 raswin.exe.gz: rasmol(win) rasmol 新版本及汉化版本 CrystInfo :用来快速、容易地构建、观察与检查晶体 3D 结 构 PDViewer: PDB 格式文件的查看程序 Weblab Viewlite :三维分子浏览工具及大量分子文件例子 Weblab ViewerPro :三维分子浏览工具 ICMLite :三维分子浏览工具,有一些其他软件没有的功能 VMD :三维分子浏览工具,可以进行动态显示 CN3D: 3D 分子结构观察软件 WPDB: PDB 文件检索显示分析软件 DTMM :三维分子模型显示、编辑与构建程序 Mole :高性能的大分子三维图形显示计算工具 gopenmol:显示并分析分子结构及其特性 POV-Rayv :生成三维图像工具软件 1 / 18 MolPOV :将 PDB 文件转化为 POV 格式文件的软件 Mol2Mol :分子文件格式转换软件 PovChem:将 PDB 文件转化为 POV 格式的文件 Ortep-3 for Windows :生成分子的热椭圆形点图 PLATON :通用结晶学软件工具 Mage:读取并演示 Kinemage 格式文件的专用软件 Prekin :将 PDB 格式文件转换为 Kinemage 格式文件 Swiss-Pdb Viewer: PDB 文件显示与分析软件 DINAMO :蛋白序列排队比较编辑与三维模型构建工具 PCMoleeule2 Lite :查看 PDB 格式文件的免费软件 StrukEd :化学分子编辑与三维模型生成软件 JMVC :使用 JAVA 技术编写的三维分子查看器 ReView :读取及分析 XYZ 格式三维分子文件 Oscail:用来处理、定义与检查小分子单晶的软件包 Moilin :分子构建与观察软件 Tinker :与 Moilin 配套的 DOS 下的分子设计建模 Biodesigner :免费的分子建模与显示软件 MoluCAD :全功能的分子建模与显示工具软件 Viewer Activex Control :三维分子显示控件 MarvinView : JAVA 语言编写的化学分子二维与三维显示程 序 ACD/3D Viewer for ISIS :免费的 ISISDraw 三维显示插件 2 / 18 Amira :高等三维显示建模系统 AmiraMol : Amira 2.3 相应的显示三维分子的增强工具 Visualize :分子建模和研究软件包 ScientificGL : C++OpenGLAPI 三维分子开发工具 Sojourner:找出小蛋白的最小能量构形并实时演示的软件 2. DNA 分析 DNAClub : DNA 处理软件 JaMBW :分子生物学软件包 DNATool :功能很全面的 DNA 序列分析工具包 pDRAW: DNA 分析与绘图软件,可绘制线性或环形 DNA 图 ANNHYB :用来帮助进行 PCR 引物设计与基因探针设计的 软件 RESTRICTION ANALYSIS :限制酶消化工具 ABIView : ABI 格式文件显示与编辑软件 Chromas: ABI 格式文件显示与编辑软件 Sequence viewer:获取与观察从 GSDB 获取的 DNA 序列数 据及其关联特性的工具 DNAssist: DNA 序列分析工具 DNAProbe :核苷酸序列设计工具 DnaSP: DNA 序列种群遗传学分析软件 DFW: DNA 分析软件 3 / 18 Artemis R4 :以 Java语言写成的序列查看工具 ’ ACT R1 :以 Java 语言写成的序列比较查看器 GDA :主要用来进行不连续基因数据的统计分析 RDP:从一组排队比较 (Align) 的核酸序列中查找潜在的重组 体软件 Sequencher:装配 DNA 小片段为大的连续序列或毗连 (序列 ) 群Contig 软件 MehCalc: 自动计算 DNA 序列热力学数据的 E

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