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高等多元统计
一、课程简介
高等多元统计分析是生物技术本科专业的一门重要的理论性基础课。高等多元统计分析是
理统计学迅速发展起来的一个分支,已广泛地应用到社会科学和自然科学的许多领域,在医学领
域、生物信息领域也有非常广泛的应用。通过本课程的学习,让学生了解各种常用多元统计分析
方法的统计背景和实际意义,熟悉各方法的统计思想及理论知识,并知道如何用这些方法去解决
医学、生物信息学中的实际问题。
学生学完本课程后,应达到如下要求:了解各种常用多元统计分析方法的统计背景和实际
意义。掌握多元正态分布的基本概念和性质。掌握聚类分析的思想和方法,并会应用聚类分析
解决实际问题。掌握判别分析的思想和方法,并会应用判别分析解决实际问题。掌握主成分分
析的思想和方法。掌握 Logistic 回归分析的思想和方法,以及 Logistic 回归在生物医学中的应
用。掌握生存率的估计、生存曲线和 Cox 比例风险回归模型在生物医学中的应用。掌握非参
检验的基本概念和性质。
二、理论教学内容
1.绪论
了解内容:各种常用多元统计分析方法的统计背景和实际意义,以及这些方法在解决医学、
生物信息学中实际问题的应用。
2. 多元正态分布
掌握内容:多元正态分布的基本概念,多元正态分布的定义及基本性质。
了解内容:多元正态分布的参数估计。
3. 多元正态总体均值向量和协差阵的假设检验
掌握内容:Wishart 分布的定义和性质,Hotelling T2 分布的定义和性质。
了解内容:多元正态分布均值向量的检验,多元正态分布协差阵的检验。
4.聚类分析
掌握内容:聚类分析的基本思想,距离和相似系 ,系统聚类法的基本性质,八种系统聚类
方法,基于 SNP 位点最小等位基因频率对人群进行聚类分析。
5. 判别分析
掌握内容:判别分析的思想和方法。距离判别法基本思想,Fisher 判别法基本思想,Bayes
判别法基本思想,逐步判别法基本思想,基因表达数据的判别分析。
6. 主成分分析
掌握内容:主成分分析的定义及其基本思想、主成分分析的应用。
了解内容:主成分分析的数学模型、主成分的推导及性质。
7.Logistic 回归分析
掌握内容:一元、多元 Logistic 回归模型及 Logit 变换;回归系数及回归方程的检验;Logistic
回归方程中系数的解释;Logistic 回归在医学中的应用。优势比、相对危险度的概念。
了解内容:运用逐步回归分析做Logistic 回归。
8.生存分析
掌握内容:生存率的估计和生存曲线,生存曲线的 Log-rank 检验。
了解内容:Cox 比例风险回归模型,生存分析在生物医学中的应用。
9.秩和检验
掌握内容:配对样本比较的 Wilcoxon 符号秩检验,两个独立样本比较的 Wilcoxon 秩和检验
(包括频数资料),多个独立样本比较的Kruskal-Wallis 秩和检验(包括频数资料)。
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了解内容:随机区组设计多个样本比较的检验方法,非参数检验注意事项。
三、实验教学内容
1.聚类分析
基本内容:距离和相似系 ,聚类分析的基本思想和方法,常用的8种系统聚类方法。
基本要求:掌握8种不同的系统聚类方法在计算机 (R语言)中的实现与应用,能够了解他
们之间的区别与联系。
2. 判别分析
基本内容:判别分析的基本思想与方法,距离判别法,fisher判别法,以及逐步判别法。
基本要求:掌握距离判别法,fisher判别法,以及逐步判别法的计算机 (R语言)实现与应用,
能够了解他们之间的区别与联系。
3.Logistic 回归分析
基本内容:Logistic 回归分析的基本思想与方法。
基本要求:掌握Logistic 回归分析在生物信息分析中的应用以及计算机 (R语言)实现。
4. 生存分析
基本内容:生存分析的基本思想与方法,生存曲线分析,Cox 比例风险回归模型。
基本要求:掌握生存曲线分析,Cox 比例风险回归模型的计算
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