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ncRNA(非编码RNA)的知识z 2010-07-31 10:36:54| 分类: | 标签: |举报|字号订阅 目录 一、核糖核酸(RNA) 二、转运RNA(tRNA) 三、信使RNA(mRNA) 四、核糖体RNA (rRNA) 五、小核RNA (snRNA ) 六、RNA 干扰(RNAi) 七、反义RNA (atRNA ) 八、核仁小分子RNA (snoRNA ) 九、细胞质小分子RNA(scRNA) 十、不均一核RNA (hnRNA) 十一、干扰mRNA 的互补RNA(miRNA) 十二、非编码RNA (ncRNA) 十三、短发夹RNA(shRNA) 十四、短干扰RNA(siRNA) 十五、核酸酶(RNase) 十六、核糖核酸酶抑制剂(RNasin) 十七、向导RNA (gRNA ) 一、核糖核酸(RNA) 1 概述 核糖核酸(RiboNucleic Acid ) ,简称RNA。由至少几十个核糖核苷酸通过磷酸 二酯键连接而成的一类核酸,因含核糖而得名。RNA 普遍存在于动物、植物、 微生物及某些病毒和噬菌体内。RNA 和蛋白质生物合成有密切的关系。在RNA 病毒和噬菌体内,RNA 是遗传信息的载体。RNA 一般是单链线形分子,也有双 链的如呼肠孤病毒RNA;环状单链的如类病毒RNA,1983 年还发现了有支链 的RNA 分子。 在RNA 病毒中,RNA 是遗传物质,植物病毒总是含RNA。近些年在植物中陆 1 续发现一些比病毒还小得多的浸染性致病因子,叫做类病毒。类病毒是不含蛋白 质的闭环单链RNA 分子,此外,真核细胞中还有两类RNA,即不均一核RNA (hnRNA)和小核RNA (snRNA )。hnRNA 是mRNA 的前体,snRNA 参与 hnRNA 的剪接(一种加工过程)。自1965 年酵母丙氨酸tRNA 的碱基序列确定 以后,RNA 序列测定方法不断得到改进。目前除多种tRNA 、5SrRNA、5.8SrRNA 等较小的RNA 外,尚有一些病毒RNA、mRNA 及较大RNA 的一级结构测定已 完成,如噬菌体MS2RNA 含3569 个核苷酸。 1982 年以来,研究表明:不少RNA,如I、II 型内含子,RNase P,HDV,核 糖体大亚基RNA 等等有催化生化反应过程的活性,即具有酶的活性,这类RNA 被称为核酶(ribozyme)。 20 世纪90 年代以来,又发现了RNAi (RNA interference,RNA 干扰)等等现 象,证明RNA 在基因表达调控中起到重要作用。 2 种类 在生物体内发现主要有三种不同的RNA 分子在基因的表达过程中起重要的作用, 它们是信使RNA (messenger RNA,mRNA)、转移(tranfer RNA,tRNA )、 核糖体RNA (ribosomal RNA,rRNA)。RNA 含有四种基本碱基,即腺嘌呤、 鸟嘌呤、胞嘧啶和尿嘧啶,此外还有几十种稀有碱基。 3 结构 1965 年R.W.霍利等测定了第 1 个核酸──酵母丙氨酸转移核糖核酸的一级 结构即核苷酸的排列顺序。此后,RNA 一级结构的测定有了迅速的发展。到1983 年,不同来源和接受不同氨基酸的tRNA 已经弄清楚一级结构的超过280 种,5S RNA 175 种,5.8S RNA 也有几十种,以及许多16S rRNA、18S rRNA、23S rRNA 和26S rRNA。在mRNA 中,如哺乳类珠蛋白mRNA、鸡卵清蛋白mRNA 和许 多蛋白质激素和酶的mRNA 等也弄清楚了。此外还测定了一些小分子RNA,如 sn RNA 和病毒感染后产生的RNA 的核苷酸排列顺序。类病毒RNA 也有5 种已 知的一级结构,它们都是环状单链;MJS2RNA、烟草花叶病毒 RNA、小儿麻 痹症病毒RNA 是已知结构中比较大的RNA。 RNA 的一级结构主要是由AMP 、GMP、CMP 和UMP 四种核糖核苷酸通过3, 5磷酸二酯键相连而成的多聚核苷酸链。天然RNA 的二级结构,一般并不像DNA 那样都是双螺旋结构,只有在一些区段可发生自身回折,使部分A-U 、G-C 碱基 配对,从而形成短的不规则的螺旋区。不配对的碱基区膨出形成环,而被排斥在 双螺旋之外。例如:tRNA 的三叶草结构。RNA 的三级结构,其中研究得最清楚 的是tRNA ,1974 年用 射线衍射研究酵母苯丙氨酸tRNA 的晶体,已确定它

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