第二章基因组学.pptVIP

国际单体型图谱项目已经从来自数个不同人群测出超过百万个单核苷酸多态性。这次将初步工作的公布象征着单体型图谱工作的一个重大里程碑。项目旨在建立一个帮助研究者发现人类疾病及其对药物反应相关基因的公众资源。 第二十九页，共三十一页。 大多数染色体区域只有少数几个常见的单体型(每个具有至少5%的频率)，它们代表了一个群体中人与人之间的大部分多态性。一个染色体区域可以有很多SNP位点，但是只用少数几个标签SNPs，就能够提供该区域内大多数的遗传多态模式。 标签SNPs （tagSNPs） 第三十页，共三十一页。 HapMap Browser 1a. Go to 1b. Select “Browse Project Data” 第三十一页，共三十一页。 基因组：细胞或生物体全部的遗传物质 基因组学：研究基因组的结构与功能。 结构基因组学：以全部基因组测序为目标，研究基因、基 因组结构、基因作图和基因定位。 功能基因组学：以基因功能鉴定为目标，研究不同序列结 构的功能、基因的相互作用，基因表达及 调控。 第一页，共三十一页。 一、人类基因组的特点 人类基因组包含30亿个碱基对. 人类基因组含3-3.5万个基因. 基因的编码序列仅占全基因组序列的3%. 存在多基因家族和超基因家族现象。 存在假基因现象。 50%DNA序列为重复序列。重复序列包括高度重复序列 (重复106)和中度重复序列 (重复10-105, 占人类 总基因35%)。卫星DNA和反向重复序列属高度重复序列。 7. 重复序列具有多态性。 第二页，共三十一页。 C值 基因组的大小通常以一个基因组中的DNA含量表示，称为生物体的C值； 不同物种的C值差别很大； C值和进化复杂性之间没有严格的对应关系，称C值悖理。 第三页，共三十一页。 HGP于1990年正式启动，其主要目标有： 识别人类DNA中所有基因； 测定组成人类DNA的30亿碱基对的序列； 将这些信息储存到数据库中； 开发出有关数据分析工具 二、 人类基因组计划（Human Genome Project，HGP) 第四页，共三十一页。 人类基因组计划最终目的是测定基因组的全部序列，弄清整个基因组的结构、功能及其表达产物，彻底了解人类生命活动本质。 第五页，共三十一页。 人类染色体 第六页，共三十一页。 为什么选择人类的基因组进行研究？ 人类是在“进化”历程上最高级的生物 认识自身 掌握生老病死规律 疾病的诊断和治疗 了解生命的起源 在人类基因组计划中，包括对五种生物基因组的研究：大肠杆菌、酵母、线虫、果蝇和小鼠，称之为人类的五种“模式生物”。 第七页，共三十一页。 HGP的主要任务 遗传图谱 物理图谱 序列图谱 转录图谱 第八页，共三十一页。 HGP的诞生 1984年12月Utah州的Alta,White R受美国能源部的委托，主持召开了一个小型会议，讨论DNA重组技术的发展及测定人类整个基因组的DNA序列的意义。 1985年6月，在美国加州举行了一次会议，美国能源部提出了“人类基因组计划”的初步草案。 1986年6月，在新墨西哥州讨论了这一计划的可行性。随后美国能源部宣布实施这一草案。 1987年初，美国能源部与国家医学研究院（NIH）为“人类基因组计划”下拨了启动经费约550万美元，1987年总额近1.66亿美元。同时，美国开始筹建人类基因组计划实验室。　　　　 1989年美国成立“国家人类基因组研究中心”。诺贝尔奖金获得者J.Waston出任第一任主任。 1990年，历经5年辩论之后，美国国会批准美国的“人类基因组计划”于10月1日正式启动。美国的人类基因组计划总体规划是：拟在15年内至少投入30亿美元，进行对人类全基因组的分析。 第九页，共三十一页。 美国：WASH＆MIT等7家研究中心，贡献率为54％。 英国：SANGER一家研究中心，贡献率为33％。 日本：RIKEN等两家研究中心，贡献率为7％。 法国：GENOSCOPE研究中心，贡献率为2.8％。 德国：IMB等3家研究中心，贡献率为2.2％。 中国：北京华大研究中心、国家南北方基因研究中心 等三家，贡献率为1％。 6国科学家组成的国家人类基因组中心主要研究比例 第十页，共三十一页。 二OOO年六月二十六日克林顿宣布人类基因草图绘制完成 第十一页，共三十一页。 基因数量少得惊人,只3.5万个. 人类基因组中存在“热点”和大片“荒漠”. 三分之一为“垃圾”DNA. 男性基因突变比例更高. HGP对人类基因