计算机辅助药物设计.ppt

计算机辅助药物设计——分子对接及虚拟筛选;内容;;合理药物设计(Rational drug design，RDD);;;;;;;;;;;;;;;;;虚拟筛选（virtual screening, VS) 也称分子对接，即在进行生物活性筛选之前，在计算机上对化合物分子进行预筛选，以降低实际筛选化合物数目，同时提高先导化合物发现效率。;虚拟筛选的效率;虚拟筛选技术的分类;基于结构虚拟筛选一般流程图;分子对接的基本原理;; 分子对接最初思想起源于Fisher E.的“锁和钥匙模型”，认为“锁”和“钥匙”的相识别的首要条件是他们在空间形状上要互相匹配 ;;;;分子对接的目的：找到底物分子和受体分子的最佳结合位置;;;;目的： 评判配体分子和受体结合能力的强弱。 含义： ① 先对同一个分子的不同结合构象，评价各构象的结合好坏。 ② 再对数据库中的不同分子的最好结合构象进行评价，以得到最终的结合能力从高到低的化合物分子清单。;;对接方法尚需解决的问题; 分子对接软件;分子对接流程;;(一) 靶点结构的预处理;;;;;;分子对接实例;人碳酸酐酶与其抑制剂复合物;抗艾滋病药物的发现——虚拟筛选;1.HIV-1蛋白酶（HIV-PR）, 所催化的水解反应在艾滋病病毒导入人体细胞过程中起着重要的作用2.高效的HIV-PR