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PAGE PAGE # / 6 最新资料推荐 走近非靶向代谢组学 文章题目为 Metabolomics Study of Hepatocellular Carcinoma: Discovery and Validation of Serum Poten?al Biomarkers by Using Capillary ElectrophoresisMass Spectrometry，是由大连化物所许 国旺教授课题组在，是由大连化物所许国旺教授课题组在 2019年发 表于 Journal of Proteome Research 上的一篇文章。 研究背景： 中国是世界上肝癌发病率较高的地区之一，并且在大多数 病例中，肝硬化都是主要的癌前病变。 由于肝癌的快速发展和早期转移，使得肝癌患者容易产生预后不 良。 事实上，如果能够肝癌做到早期诊断，可以大大改善患者的治愈 效果，但是至今，对于肝癌的高危人群来说，早期的诊断仍然充满挑 战。 目前，超声波检测和血清AFP检测仍然是常用的肝癌筛查 手段。 其中，超声波检测不能够很灵敏的区分小的肿瘤和肝硬化结节； AFP检测虽然有效，但是其灵敏度还远不能让其成为一个理想的特异 性检测肝病的方法，这些问题也影响着肝癌的早期诊断和治疗， 因此 寻找一些新的生物标记物用于临床诊断肝癌显得非常重要。 代谢组学作为系统生物学的一个工具，已经越来越多的使 用在了临床研究中 目前，NMRGC-MS LC-MS作为常用的代谢组学研究工具，对我 们了解疾病的发生发展提供了很多有用的线索。 由于仪器本身的限制，过去的研究忽略了对一些极性较大以及离 子型代谢物，而这些化合物在生物体内也起着不可或缺的作用， 因此 作者在本研究中使用CE-MS作为工具，研究肝癌患者血清中较大极 性代谢物的变化。 研究方法： 样本来源： 血清样本（n=183）包括健康人，肝硬化患者，以及肝癌患者（为 了验证标记物早期诊断能力，将肝癌患者又细分为小肿瘤和正常肿 瘤）。 其中77例样本用来建立模型，寻找标记物；106例样本用来验 证所寻找的标记物的诊断能力。 样本前处理： 氯仿除杂，水相超滤离心除蛋白。 通过混合相同体积的血清样本配置 QC样本，前处理方法同样本。 CE-MS 分析： 为减少batch effect ，所有样本检测顺序随机，同时每检测是 个样本后，检测一次QC样本。 统计分析： 观察整体分组情况Multivariate variate an alysis (PLS-DA) 观察整体分组情况 最新资料推荐 Uni variate an alysis 是否有统计学意义 Wilcoxon Ma nn-Whit ney Test False discovery rate (FDR) Hierarchical cluster analysis (HCA)观察代谢物之间的联系Z-score plot观察样本的分布 Receiver operati ng characteristic (ROC) 评价标记物的诊断能力 整体工作流程结果方法果与讨论： 法学考察 QC样标记多元图ACD.V的化图B图E区间图C最 终代谢样本中，有超记物的选择(元统计分析筛A.得分图显示VIP1 的化合化合物有42个B. Venn图取二E.图中化合物间，将其去除 CD.将图中p终选出27个化谢标记物的验超过90%的化(77个血 清样筛选(筛选出示健康人，肝合物被认为对个。 二者交集，3物glycocholic 除。 p(corr) 值大于化合物。 验证和评价(合物的RSD样本)27个化合物肝硬化患者，分 类贡献较大30个化合物被c, acid, tyros于0.3的化合物106个 血清样20%证明所物) 已经肝癌患大，图中可以被选出。 sine (Tyr), 和物去除。 (文样本)所建立的方法患者被分为三以看出 VIP1和malic acid在文中有参考文法有很好的稳三组。 1 的化合物有在VIP1柱形文献) 稳定性和重复有41个，VI 形图中处于负性。 P21 置信 排除 了 3QC样生物样本合使敏度个，选择在 肝癌除了 pipecolic 选择在小肿3/4-methyl-2-样本中的峰面物标 记物诊断作者对这四本进行区分， 且使用，可以得相比于单个度和特 异性。 这三种化合分别是Trp，癌患者vs健康c acid 。 肿瘤vs肝癌，-oxovaleric a 面积RSD值在断能力的评价四 个化合物做且有很好的灵得到更好的效个标记物， 合 合物在所有组， Gln和2-hy康人，以及肝癌以及小肿瘤 acid。 最终选在1%-6%之间价。 做了 ROC分析灵敏度和特异效果。 合理的将标记物组别中的相对含 ydroxybutyric 癌患者vs肝 硬瘤vs健