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生物信息学的算法§1生物信息学研究方法概述1、1 生物信息学研究得三个层面初级层面中级层面高级层面初级层面基于现有得生物信息数据库与资源,利用成熟得生物信息学工具(专业网站、软件)解决生物信息学问题——生物信息数据库(NCBI、EBI等)——基因组序列分析、序列比对软件(GCG、BLAST、CLUSTAL等)——系统发育树构造软件(PHYLIP、PALM、MEGA等)——分子动力学模拟软件(GROMACS、NAMD等)——搜集、整理有特色得生物信息学数据集中级层面利用数值计算方法、数理统计方法与相关得工具,研究生物信息学问题——概率、数理统计基础——科学计算基础——现有得数理统计与科学计算工具(EXCEL、SPSS、SAS、 MATLAB等)——建立有特色得生物信息学数据库高级层面提出有重要意义得生物信息学问题;自主创新,发展新型方法,开发新型工具,引领生物信息学领域研究方向。——面向生物学领域,解决生物学问题——数学、物理、化学、计算科学等思想与方法——建立模型,发展算法——自行编程,开发软件,建立网页(Linux系统、C/C++、PERL、数据库技术)从事生物信息学研究应具备多方面得科学基础:(1)、一定得计算能力,包括相应得软、硬设备。要有各种数据库或者能与国际、国内得数据库系统进行有效得交流。要有发达、稳定得互联网络系统;(2)、强有力得创新算法与软件。没有算法创新,生