基于RNA⁃seq技术对大骨鸡垂体及下丘脑组织的SNPInDel分析.docx

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2022-10-18 发布于河北
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基于RNA⁃seq技术对大骨鸡垂体及下丘脑组织的SNPInDel分析.docx

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摘要下丘脑和垂体调节母鸡的生殖生理和产蛋性能。为了解其产卵调控机制，利用RNA?seq技术对高产和低产庄河大骨鸡的下丘脑和垂体组织进行测序和分析，获得SNP/InDel位点，并进行数据统计及生物信息学分析，以鸡基因组作为参考，对SNP所在基因进行GO富集分析。结果显示：SNP/InDel纯合子变异体数量高于杂合子变异体数量，垂体组织中的SNP/InDel数量高于下丘脑组织；SNP类型转换种类少于颠换，但转换类型的数量却远远高于颠换；垂体组织中的SNP所在基因的GO富集程度与生产性能呈负相关关系（P0.05），下丘脑组织中的SNP所在基因的GO富集程度与生产性能呈正相关关系（P0.05）。研究