R语言初级教程.docxVIP

R语言初级教程 郑卫军老师 公众号“医学论文与统计分析” 浙江中医药大学 医学统计教研室  目录 TOC \o 1-3 \h \z \u 医学研究人员为什么要学习R语言 1 给所有R语言初学者的几点建议 4 第一部分 R语言基本介绍 第1讲 R及Rstudio 介绍、安装 6 一、认识R与Rstudio 6 二、 利用Rstudio进行基本操作 7 第2讲 R程序和R数据介绍 10 一、R语言程序 10 二、R数据 13 第3讲 R语言对象类型 17 一、向量（一维数据） 17 二、矩阵（二维数据） 20 三、数据框（数据表） 23 四、列表 27 小结 R语言对象的操作总结 30 一、is和as系列函数 30 二、子集的提取（数据索引） 32 第二部分 R语言进行数据整理 第4讲 数据集导入导出及描述 36 一、 工作空间 36 二、数据集导入 37 三、数据集的导出 38 四、数据集的基本描述和总结 39 第5讲 数据集整理（1）：数据提取及删除 40 一、 子集提取 40 二、变量名剔除 42 第6讲 数据集整理（2）：数据集合并及变量更改 44 一、数据集合并 44 二、变量名重命名 45 三、变量属性的更改 46 四、数据集排序 46 第7讲 数据集整理（3）：变量的添加转化 48 一、添加变量 48 二、变量值的转化 49 第8讲 数据集整理（4）：缺失值处理 51 一、查找缺失值 51 二、处理缺失值 52 第9讲 R语言必学包dplyr 54 一、数据库合并 55 二、筛选: filter() 56 三、排列: arrange() 56 四、选择: select() 57 五、变形: mutate() 57 六、汇总: summarise() 59 七、分组: group_by() 60 八、dplyr 包其它重要函数 60 第10讲 tidyr包R语言数据整理又一利器 61 一、宽数据转为长数据gathe()函数 61 二、长转宽：spread() 63 三、合并：unit() 63 四、拆分：separate() 64 第11讲tidyverse系列包，数据整理当红辣子鸡 65 R语言数据清洗和整理总结 68 一、数值变量数据转为分类变量数据 68 二、分类变量数据因子化和转换 69 第三部分：R语言基本分析 第12讲 常用统计描述方法 97 一、定量资料的描述 97 二、分类资料的描述 97 三、dplyr包在统计描述的应用 98 四、gmodels包在交叉表当中的应用 98 第13讲 apply族函数的应用 99 一、函数apply() 99 二、函数lapply() 100 三、函数sapply() 100 四、函数tapply() 101 五、函数mapply() 101 六、医学数据分析中apply族的应用 102 第14讲?如何使用R语言进行假设检验 104 一、 正态性检验 104 二、方差齐性检验 104 三、t检验 105 四、方差分析 105 五、卡方检验 106 六、秩和检验 106 第四部分：R语言回归分析 第15 讲 利用R语言进行线性回归分析 108 一、准备工作 108 二、简单线性回归分析 108 三、多因素线性回归分析 110 四、多因素线性回归结果的提取 113 五、回归诊断 114 第16讲 利用R语言进行logistic回归分析 116 一、准备工作 116 二、数据整理工作 116 三、logistic回归分析 118 四、broom包的在回归分析中的应用 121 第17讲 利用R语言进行生存分析 123 一、案例 123 二、准备工作，导入R语言导入生存分析包，导入数据 123 三、进行数据的整理 124 四、接种开展K-M分析，进行logRank分析 124 五、进行COX回归分析 125 六、broom函数的应用 126 第五部分：R语言快速成文法 第18讲 logistic回归的快速成文法 128 一、logistic分析案例 128 二、准备工作 130 1、准备工作 130 三、影响