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原核微生物 The Prokaryotes;Chapter Outline;第一节 原核生物的分类和鉴定;二界系统:微生物发现之前,1753年,瑞典人林奈(Carl vpm Linne)提出两界分类系统。即生物分为动物界和植物界。
三界系统:1866年Haeckel把生物分为动物界、植物界和原生生物界。
;1969年,美国生物学家魏泰克(R. H. Whittaker)根据细胞结构及营养吸收方式的不同提出。
原核生物界:细菌、放线菌、蓝细菌
原生生物界:原生动物、单细胞藻类
真菌界:真菌、酵母
植物界
动物界
;2. 反映生物系统发育相关性的进化计时器;三域 (三原界) 分类学说;二 、 原核生物的分类系统;《伯杰氏系统细菌学手册》
(Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology);美国微生物学会组织编写《伯杰氏鉴定细菌学手册》
(Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology);第1版:1984年 四卷
第2版:2000年 五卷 纳入研究核糖体RNA测序的结果,分古细菌、细菌两个界共31个部分;细菌分类学包括三个方面:
分类(classification):根据各种细菌的相似性进化关系将其分为类群,排放在适当的单元中
鉴定(identification):是分类的操作过程,经过一系列测定来确定所研究的菌株属于哪个类群
命名 (nomenclature):根据命名的国际法规对所鉴定的菌株给以科学名称;原核生物的分类等级
原核生物界(Kingdom)、门(Phylum)、纲(Class)、目(Order)、科(Family)、属(Genus)、种(Species)。
种的概念
种是分类的基本单位,是表型特征和包括DNA和16SrRNA在内的基因序列特征高度相似的菌株群,且和其它类群又有明显的差别。;一个微生物的种具有如下特征;菌种命名原则;; 种以下分类;几个概念;模式的概念;(二) 原核生物分类鉴定的依据和方法;1. 传统分类依据;1) 细菌的个体形态;细菌的基本形态有球状、杆状、螺旋状;球菌细胞分裂后常呈一定的空间排列形式,这些排列方式在分类上有一定的意义,根据细胞分裂后细胞的排列方式球菌又分为:;细胞分裂后的排方式不同;(1)单球菌
分裂后的细胞分散而单独存在的球菌.
如尿素微球菌(Micrococcus ureae);;;(4)四联球菌
分裂是沿两个相垂直的平面进行,???裂,分裂后每四个细胞在一起呈田字形.
如四联微球菌
(Micrococcus tetragenus);(5)八叠球菌
按三个互相垂直的平面进行分裂后,每八个球菌在一起成立方体形.
如尿素八叠球菌(Sarcina ureae);(6)葡萄球菌
分裂面不规则,多个球菌聚在一起,像一串串葡萄。
如金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus);杆菌的细胞呈杆状或圆柱状。粗短、细长、两端平截、略尖、半圆。
杆菌分裂面只有一个。
杆菌是细菌中种类最多的一群细菌,生产中所应用的细菌也大多是杆菌。;
;
;菌体呈螺旋状的原核生物,根据螺旋的数目分为螺旋菌与弧菌。
菌体弯曲不足一圈的叫弧菌如霍乱弧菌(Vibrio cholerae)
菌体弯曲一圈以上的叫螺旋菌。
弯曲六周以上的又称螺旋体。;螺旋菌又分为弧状和螺旋状; ;当环境条件不适合某细菌生长时,会导致细菌产生异常形态。; 细菌大小的表示采用μm 为单位:
球形:用直径表示,0.5~1 μm
杆菌:宽 0.5 ~1μm, 长为宽的1至几倍, 用宽X长表示
螺旋菌与杆菌相似,采用宽X长和螺距表示。;细菌的繁殖;细菌的运动;2) 细菌的群体形态;菌落(colony):在固体培养基上,由一个或少数几个细菌繁殖的后代集聚在一起形成的形态; 菌落形态可作为分类鉴定的依据,包括:形态、大小、隆起度、边缘、颜色、粘度、透明度等;细菌的菌落特征;菌苔(lawn):大量微生物接种在固体培养基上繁殖的后代集聚在一起形成的形态。;
明胶、琼脂穿刺培养形成的液化区、生长区的群体形态,也是鉴定的依据之一。
液体培养时的群体形态:有表面形成菌膜、均匀混浊和沉淀等。;2. 原核微生物的分类方法;传统分类方法; 数值分类法(numerical taxonomy) 又称聚类分类法或安德生法;细胞壁的组成
脂质:为细胞膜的主要成分
异戊烯醌:存在于细胞膜,在电子传递
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