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代谢概论(An Introduction to Microbial Metabolism) 一. 基本概念1. 新陈代谢(Metabolism)2. 代谢途径(Metabolic pathway)直ab cd A 底物Substrate C 中间产物Intermediate E 终产物End productBD线途径 gD分F HG d fC支abc h的ABE代谢途径3. 合成代谢途径(Anabolic pathway)和分解代谢途径(Catabolic pathway)?区别3. 合成代谢途径(Anabolic pathway) 和分解代谢途径(Catabolic pathway)?联系分解葡萄糖→ → →乙酰乳酸→ →乙酰甲基甲醇合 ↓成 ↓缬氨酸4. 初级代谢(Primary metabolism)和 次级代谢(Secondary metabolism)?存在的普遍性?产物功能?存在的阶段?生理功能?对环境的敏感性和遗传的稳定性?酶的底物专一性５、代谢组(metebolome)和代谢组学(metebolomics)代谢组(metebolome):在某一时刻细胞内所有代谢物的集合。代谢组学(metebolomics)：定量描述生物内源性代谢物质的整体及对内因和外因变化应答规律的科学。二. 微生物代谢的研究方法1. 研究代谢的战略 在天然培养基上培养的微生物混合物 在天然培养基上的纯培养 在合成培养基上的纯培养采用静息细胞研究代谢采用无细胞提取液研究代谢代谢调控的研究分子的运动及传递的研究代谢组学的研究2. 研究代谢的方法细胞水平（营养平衡法、瓦勃格氏压力计法、营养缺陷型法）分子水平（同位素示踪法、酶的抑制剂法）基因水平（基因替代、DNA运动性改变）基因组水平（鸟枪克隆、核酸序列测定、ORF寻找结构基因、同源序列比较预测功能、基因芯片）蛋白质组水平（双向电泳）代谢组水平（NMR、MS、HPLC、GC)2. 研究代谢的方法? 营养平衡(Nutrient balances)? 生物化学——酶? 同位素标记法(Radioactively labelled compounds)? 瓦勃格氏(Warburg)呼吸计法2. 研究代谢的方法? 营养平衡(Nutrient balances)静息细胞（休止细胞）（resting cell）C平衡：底物的C = 产物的C氧化还原平衡：氧化态的C = 还原态C丙丁梭菌的丁醇丙酮发酵的C平衡与O/R平衡基质与 摩尔/100摩尔摩尔碳O/RO/R产物基质(每分子)(摩尔/100摩尔)葡萄糖丁酸乙酸CO2 H2乙醇丁醇丙酮总计100 4 14 221 135 7 56 22600 16 28 221 0 14224 66569 0 -2 0+2 -1 -2 -4 -2 0 -8 0 +442 -135 -14 -224 -44-425, +442生物化学——酶加入酶的抑制剂寻找突变株寻找突变株类型生长不能生长积累的中间产物ＡＡ、ＢＡ、Ｂ、ＣＡＢＣB、Ｃ、ＤＣ、ＤＤＥＡ、Ｂ、Ｃ、 ＤＤ基因替代 (gene replacement)凝胶延滞(gel shifts and supershifts)基因芯片(gene chip)Suicide mutagenesis3. 研究代谢的方向Peter Mitchell标量代谢(scalar metabolism)向量代谢(vectorial metabolism)代谢途径代谢网络复习与思考题：1、静息细胞的概念。2、掌握营养平衡的计算方法。3、某一菌株发酵葡萄糖产生乙醇和二氧化碳。如何测得它主要走EMP途径还是ED途径？4、代谢组学的概念。 产能代谢(Energy Yielding Metabolism)第一节 能量来自有机化合物第二节 能量来自无机物第三节 能量来自光第一节 能量来自有机化合物碳水化合物烃二碳、一碳化合物内源性储藏物质含氮化合物脂肪第二节 能量来自无机物氢细菌铁细菌硫化细菌亚硝化细菌和硝化细菌第三节 能量来自光不产氧光合作用产氧光合作用极端嗜盐菌紫膜的光合作用第一节 能量来自有机化合物碳水化合物烃二碳、一碳化合物内源性储藏物质含氮化合物脂肪第一节 能量来自有机化合物(Energy From Organic Compounds)一. 碳水化合物的降解(Pathway of Carbohydrate Breakdown)(一) 葡萄糖(二)其它单糖(三)多糖第一节 能量来自有机化合物(Energy From Organic Compounds)一.碳水化合物的降解(一) 葡萄糖(1) 葡萄糖降解途径1. EMP途径2. ED3. HMP4. 磷酸解酮酶途径PKTCA循环1.EMP途径Em