分子动力学模拟势函数.pptxVIP

会计学1分子动力学模拟势函数 长程相互作用静电相互作用是长程相互作用 电荷-电荷 ~ 1/r电荷-偶极 ~ 1/r2偶极-偶极 ~ 1/r3第1页/共56页 基于电荷基团的截断半径 Rc以2个水分子为例总相互作用能 -0.27kcal/molO---O 29 kcal/molO---H -59.4 kcal/molH---H 29.2 kcal/mol第2页/共56页 截断半径范德华相互作用 0.8A静电 1.4A第3页/共56页 Ewald加和Ewald 1921提出用于一个粒子与盒子中其它粒子以及周期性盒子中其它粒子的相互作用立方体边长 i,j,k=0,1,2,3….在中心盒中有N个电荷，电荷-电荷相互作用 n=0 中心盒 ‘不包括