生物化学蛋白质结构.pptxVIP

第四节 蛋白质的结构（一）蛋白质的一级结构1、多肽与蛋白质a 多肽的分子量足够大、具有一定空间结构和构象时， 就成为蛋白质。b 一级结构和化学结构： 一级结构，aa的序列。 化学结构，肽链的数目、端基组成、aa序列、-S-S-的 位置、等等（共价结构）。c 一级结构，从N端到C端的aa的排列顺序。第一页，共二十三页。2．一级结构的测定 ——序列测定前的准备工作：样品的纯度 > 97%相对分子质量 允许误差10%——一级结构的测定主要用小片段重叠的原理 6多肽链的断裂7测定各肽段的氨基酸顺序8确定肽段在多肽链中的次序9确定二硫键的位置。1蛋白分子中多肽链的数目2拆分蛋白分子中的多肽链3测多肽链的氨基酸组成4N端和C端的测定5断裂二硫键第二页，共二十三页。——肽段的分离和氨基酸序列测定 ——找重叠肽从而推断整个肽链的氨基酸序列 ——二硫键位置的确定 对角线电泳 第三页，共二十三页。——蛋白质测序举例 2130insulin—— 一级结构测定展望DNA序列测定发展很快，相应于蛋白质的DNA序列测定出来后，推出蛋白质的序列，蛋白质一级结构的的曙光。 第四页，共二十三页。（二）蛋白质的高级结构 1．维持蛋白质高级结构的主要作用力——化学键 维持蛋白质构象的次级键氢键离子键疏水键范德华引力二硫键配位键 2．蛋白质空间结构的研究方法 X-射线衍射法、核磁共振、光谱法（红外光谱、紫外差光谱、荧光光谱）、旋光色散法、园二色性、氢同位素交换法等。 第五页，共二十三页。3、蛋白质的结构层次——多肽和蛋白质：当多肽的分子量大到足够具有一定的空间结构时就称为蛋白质。 ——结构层次：超二级结构二级结构一级结构四级结构结构域三级结构第六页，共二十三页。4.蛋白质的二级结构 ——蛋白质的二级结构是指多肽链本身的折叠和盘绕方式。 0.15nm100o(1) α-螺旋 1950年美国Pauling等人在研究纤维状蛋白质时，提出了α-螺旋，后来发现在球状蛋白质分子中也存在α-螺旋。 氢键0. 5nm氢键；稳定性：同电荷、Pro、Gly、大R。第七页，共二十三页。(2) β-折叠 也是pauling等人提出来的，它是与α-螺旋完全不同的一种结构。① β-折叠主链骨架以一定折叠形式形成一个折叠片层。② 在两相邻肽链间形成氢键③ 有平行和反平行两种形式 ④ 每aa在主轴所占距离为：平行0.325nm，反平行0.35nm。 第八页，共二十三页。(3) β-转角 (β-turn) β-转角是指蛋白质分子的多肽链经常出现180o的回折，在回折角上的结构就称β-转角，也称发夹结构，或称U形转折。由第一个氨基酸残基的C=O与第四个氨基酸残基的N—H之间形成氢键。(4) 无规卷曲 无规卷曲：指表面上看没有规律性的肽链结构，但许多蛋白质的功能部位常常埋伏在这里。 (5) 胶原纤维 胶原蛋白中的一种特殊二级结构：甘氨酸、脯氨酸（羟脯氨酸）、其它氨基酸组成的三肽单位重复单位——左手螺旋——三股螺旋进一步形成右旋的超螺旋结构。第九页，共二十三页。(6) 二级结构举例 ——α-角蛋白——胶原蛋白——丝蛋白第十页，共二十三页。5.蛋白质的超二级结构和结构域 （1）超二级结构：是1973年Rossmann提出的，它是指二级结构的基本结构单位（α-螺旋，β-折叠等）相互聚集，形成有规律的二级结构的聚集体。已知的超二级结构主要有αα，βαβ， ββ 。 第十一页，共二十三页。（2）结构域结构域：是 1970年Edelman提出的，它是指在较大的球状蛋白质分子中，多肽链往往形成几个紧密的球状构象，彼此分开，以松散的肽链相连，此球状构象就是结构域。 最常见的结构域约含100～200个氨基酸残基，少至40个左右，多至400个以上。结构域是球状蛋白质的折叠单位，多肽链折叠的最后一步是结构域的缔合。对那些较小的蛋白质分子来说，结构域和三级结构往往是一个意思，也就是说是单结构域的。一般来说，大的蛋白质分子可以由2个或更多个结构域组成。 第十二页，共二十三页。6. 蛋白质的三级结构蛋白质的三级结构：是指在二级结构基础上，多肽链再进一步折叠盘绕成更复杂的空间结构，三级结构主要靠非共价键来维持。 1963年kendrew等通过x-射线衍射分析，测得鲸肌红蛋白空间结构(1)一条多肽链折叠盘绕成近球状构象。 (2) 80%α-螺旋（A…H），其余无规卷曲， (3) 亲水基——表面，疏水基团——内部。 (4) 血红素辅基垂直伸出分子表面，通过一个His残基和分子内部相连。第十三页，共二十三页。7.蛋白质的四级结构 四级结构：是指蛋白质的亚基聚合成大分子蛋白质的方式亚基：是指一条多肽链或以共价链连接在一起的几条多肽链组成的蛋白质分子的最小共价结构单位。 英国科学家Max.Perutz：血红蛋白（hemoglobin