Genemapper微卫星分析中文操作指南.docxVIP

GeneMapper软件 微卫星剖析中文简略操作手册 微卫星剖析流程： 设定微卫星剖析方法： 登录软件 创立剖析所需kit、panel和marker等参数； 创立新文件，导入数据； 设置剖析参数； 履行初始剖析； 剖析并检查结果： 编写剖析方法； 剖析数据； 查察结果； 打印并导出数据（可选）： 打印结果； 导出结果。 软件术语介绍： 术语 定义 Analysis 软件中剖析样品所使用的特定设置；用于计算片段大小和基因 Parameters 型，这些特定设置包括 和 analysismethod,sizestandardpanel bin 在marker内设定等位基因的片段大小和颜色 binset 等位基因特定实验条件下一组 bin marker 微卫星标记，经过位点名称、片段大小、荧光标记和重复长度 进行设定 panel Marker组合 kit panel组合 一．设定微卫星剖析方法： 1.登录GeneMapper软件： 1.1选择开始--AllPrograms--AppliedBiosystems--GeneMapper--GeneMapper； 或双击桌面快捷方式翻开软件； 1.2登录GeneMapper软件：用户名默认为gm，在Passwprd中输入密码，点 击OK进入GeneMapper软件 2创立剖析所需kit、panel和marker等参数: 2.1点击软件上方工具栏Tools，选择PanelManager； 2.2在PanelManager对话框中，选中1PanelManager，点击2新建Kit；于NewKit对话框中依次输入Kit名称，Kit种类，并点击OK保留设置； 2.3在PanelManager对话框中，选中1STRKIT，点击2新建Panel；3中输入Panel名称； 2.4选中1STRpanel，点击2新建Marker，在3地点依次输入MarkerName (Marker名称)，DyeColor(荧光标记种类)，MinSize，MaxSize片(段最小值和最大值)，MarkerRepeat(重复次数)； 2.5重复2.4步骤，达成所有Marker设置，点击OK保留； 创立新文件，导入数据： 3.1点击1新建文件夹，在2ProjectType中文件夹种类选择Microsatellite，点 击OK； 3.2导入数据：点击1AddSamplesToProject增添数据，在弹出的对话框中选择待剖析数据，经过3AddToList增添到右边的面板中，点击4Add达成数据增添； 设置剖析参数： 4.1达成数据增添后，在1地点，AnalysisMethod中选择NewAnalysisMethod新建剖析方法；在弹出的对话框中选择剖析种类2Microsatellite，点击OK确认； 4.2设置剖析参数：在AnalysisMethodEditor中，点击1General，填写2Name （剖析方法名称）；之后点击3Allele，在将4BinSet选择none；其余 参数为软件默认，不需要改正；点击OK确认； 4.3选定好以前设定的剖析方法，在后续的栏目中设定Panel和SizeStandard （分子量内标）； 4.4达成剖析参数设定后，选中AnalysisMethod，Panel和SizeStandard栏目，点击1File，选择2FillDown；此时，AnalysisMethod，Panel和Size Standard栏目会使用以前选定的剖析参数；也能够使用鼠标分别选择； 4.5保留剖析文件：点击File，选择SaveProject，输入文件夹名称： 履行初始剖析： 5.1点击剖析按钮1，剖析数据： 5.2在1Genotypes中查察初步剖析结果，或经过2DisplayPlots选项查察样品 分型图： 5.3在样品分型图界面中，PlotSetting选择MicrosatelliteDefault；经过软件上方 的快捷按钮编写数据显示方式： 6创立BinSet： 6.1翻开Tools—PanelManager，选中1STRKit，点击2新建BinSet，在弹出的 NewBinSet对话框3中输入BinSet名称： 6.2增添参照数据： 6.2.1保证1BinSet已选择新建的BinSet，选中2STRPanel，此时会显示出以前新建的每个Marker，点击3AddReferenceData增添参照数据； 6.2.3在AddMicrosatelliteReferenceData对话框中，选择1参照数据，经过2 AddToList增添至右面的面板中，点击3Add，达成增添： 6.3生成BinSet：达成参照数据增添后，点击1AutoBin，之后使用软件默认参 数，点击2OK，自动生成BinSet： 6.4编