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染色质免疫沉淀法（Chromatin immunoprecitation，ChIP）是研究体内 DNA 与蛋白质相互作用的重要工具。它可以灵敏地检测目标蛋白与特异 DNA 片段的结合情况，还可以用来研究组蛋白与基因表达的关系。核小体组蛋白可以发生多种翻译后的共价修饰，如乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化等，这些共价修饰与真核基因的表达密切相关。根据“组蛋白密码”假说， 组蛋白的各种共价修饰的组合会以协同或拮抗的方式诱导特异的下游生物学功能，因此， ChIP 也为研究组蛋白修饰在基因表达中的作用，全面阐明真核基因的表达调控机制提供了强有力的研究工具。 真核生物细胞状态是由内源和外源因素共同影响的，所有信号传递途径的终点都是 DNA。DNA 通过核蛋白复合物组成染色质，染色质是基因调控的一个重要作用位点。转录激活因子和辅助抑制因子的研究显示存在一种新的调节机制--“组蛋白密码”，其信息存在于组蛋白的转录后修饰等过程中。该类修饰包括组蛋白磷酸化、乙酰化、甲基化、ADP-核糖基化等过程。随着越来越多组蛋白核心结构区域和羧端修饰的确定，组蛋白密码在控制和调节基因功能过程中的作用越来越明确。参与修饰的酶根据其作用的不同而分类：如组氨酸乙酰转移酶 （HATs）可以将乙酰基团转到组蛋白上；组蛋白去乙酰酶（HDACs）可以去除氨基酸上的乙 酰基团；组蛋白甲基转移酶（HMTs）可以将甲基基团转移到组