原创力文档- 1、本文档共9页，可阅读全部内容。
- 2、原创力文档（book118）网站文档一经付费（服务费），不意味着购买了该文档的版权，仅供个人/单位学习、研究之用，不得用于商业用途，未经授权，严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等，侵权必究。
- 3、本站所有内容均由合作方或网友上传，本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺！文档内容仅供研究参考，付费前请自行鉴别。如您付费，意味着您自己接受本站规则且自行承担风险，本站不退款、不进行额外附加服务；查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档，您可以点击 这里二次下载。
- 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等，请点击“版权申诉”（推荐），也可以打举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。
查看更多
MEGA version 6: Molecular Evolutionary Genetic Analysis 1
MEGA简介MEGA是一款用于分子进化遗传分析的软件。MEGA可用于序列比对、进化树的构建、估计分子进化速度、验证进化假说等。下载地址：/2
MEGA version 6: Molecular Evolutionary Genetic AnalysisTwo ways to create a multiple sequence alignment1.Open the Alignment Explorer,paste in a FASTA MSA2.Select a DNA query,do a BLAST searchonce your sequences are in MEGA,you can run ClustalWthen make trees and phylogenetic analyses3
[3] Click DNA or Protein[2] Select Create a new alignment[1] Open the Alignment explorer4
[4] Find,select,and copy a MSA(eg.FASTA)[5] Paste it into MEGA5
[6] If needed,run ClustalW to align the sequences[7]Save (Ctrl+S)as .mas then exit and save as.meg注：多序列比对结果中，红色表示酸性AA;蓝色表示碱性AA;粉色表示中性亲水AA;深绿色表示脂肪族AA;浅绿色表示芳香族AA;黄色表示含硫AA;橙色表示含亚氨基的2条序列的相似度为52%6
7
Clustal X下载地址：/8
作业1.选择一个自己感兴趣的蛋白质，下载不同物种中此蛋白质的序列，用MEGA软件进行多序列比对。2.查找SARS病毒的核酸序列，选择其中5条下载后用Clustal x软件进行多序列比对。9
文档评论（0）