植物表观遗传学.pptxVIP

植物表观遗传学第1页/共82页第2页/共82页Epigenetics（表观遗传学）:是指以不涉及到DNA序列的改变、但可以通过有丝分裂和减数分裂进行遗传的生物现象。第3页/共82页自然界中的表观遗传学现象：Paramutation最早的例子来自果蝇的变化。Muller, H.J. (1930). Types of visible variations induced by x-rays in Drosophila.J Genet. 22, 299–334.Hinton, T., and Goodsmith, W. (1950). An analysis of phenotypic reversions at the brown locus in Drosophila. J. Exp. Zool. 114, 103–114.第4页/共82页Paramutation has been extensively characterized at three maize loci: r1,b1（helixloop-helix (bHLH) factors）, and pl1(myb)Brink (1956, 1958) 首先描述了r1基因的 Paramutation 现象第5页/共82页Chandler et al, PMB, 2000第6页/共82页Chandler et al, PMB, 2000第7页/共82页With activating mutatorChandler et al, PMB, 2000第8页/共82页Paramutation 是由基因控制的mop1:mediator of paramutation1，RNA dependent RNA Pol IVDorweiler et al, Plant cell, 2000Alleman et al., Nature, 2006, 442:295-8. 第9页/共82页In B-I: more methylation, but more open chromatin structure 853-bp repeats In B-P: less methylation, more dense chromatin structureHigh expression Low expressionStam et al., 2002, Gene Dev第10页/共82页Henderson IR, Jacobsen SE. Nature, 2007447:418-24 第11页/共82页目前表观遗传学研究概况第12页/共82页拟南芥作为模式植物的优点:个体小，易于管理生长周期短，种子量大易于转化，进行基因功能研究基因组小，重复序列少，完成测序第13页/共82页表观遗传学的分子生物学机制包括：DNA甲基化组蛋白修饰染色质重组RNA干扰第14页/共82页植物DNA甲基化的分子机制A DNA molecule consists of two strands, each strand = polynucleotide.Strands held together by hydrogen bonds between complementary nucleotide pairs: Adenine with Thymine, Cytosine with Guanine.第15页/共82页CH3double-helix structure第16页/共82页CH3CNGCH3CHH (C/A/T)植物DNA甲基化的形式CH3动植物共有CG第17页/共82页DNA甲基化的生物学意义：调控转座子的活性，保护基因组DNA调控基因的表达第18页/共82页如何研究植物的DNA甲基化DNA甲基化敏感的限制性内切酶亚硫酸氢钠测序：重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变，PCR扩增所需片段,则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶，最后,对PCR产物进行测序 HPLC：整体基因组甲基化水平, 免疫化学法：利用特异的5mC抗体，结合整体基因组芯片，测定DNA甲基化区域第19页/共82页RNA介导的DNA甲基化最初发现Wassenegger M, Heimes S, Riedel L, S?nger HL. RNA-directed de novo methylation of genomic sequences in plants Cell. 1994 Feb 11;76(3):567-76 Max-Planck-Institut für Biochemie, Abteilung Viroidforschung, Martinsried, Federal Republic of Germa