基因组学的合成和加工详解演示文稿.pptVIP

涉及果蝇性别决定的基因在表达过程中的剪接调控 现在是31页\一共有36页\编辑于星期五 人slo基因 现在是32页\一共有36页\编辑于星期五 反式剪接来自不同转录单位的外显子 来自于SL RNA的前导外显子通过剪接被连接到不同的RNA分子上 现在是33页\一共有36页\编辑于星期五 真核细胞前体rRNA的剪接 真核前体rRNA中的内含子不多见 内含子是自催化的，不需要蛋白质 I类内含子 现在是34页\一共有36页\编辑于星期五 真核细胞前体tRNA的剪接 tRNA内含子在低等真核生物中较为常见，脊椎动物中较少 前体tRNA的剪接不涉及转酯反应 两个剪接位点被核糖核酸酶切割 酿酒酵母前体tRNA的剪接 现在是35页\一共有36页\编辑于星期五 真核生物RNA的化学修饰 酵母U24-snoRNA参与的甲基化修饰 现在是36页\一共有36页\编辑于星期五 转录延伸阶段的细菌RNA聚合酶以四亚基组成的核心酶形式存在，包括两个α亚基，β和β‘亚基，δ亚基已经离开，它只在转录起始阶段起关键作用。 RNA聚合酶覆盖的模板DNA片段长约30bp，包含12-14bp的转录泡，其中RNA-DNA杂合链的长度是8-9bp。 转录中RNA聚合酶将两条DNA链暂时分开，形成转录泡，接着使用其中的一条联作为模板，指导合成互补的RNA。 RNA聚合酶必须稳定结合DNA模板以及RNA，防止转录未到终点就脱离，然而结合也不能过于牢固，以免聚合酶不能沿DNA滑动。 * RNA聚合酶β和β‘亚基以橙色表示，数字表示根据交联实验确定的DNA或RNA相近的氨基酸位置，DNA或RNA与氨基酸之间的交联以粉红色细线表示。 * 组合上述数据和X射线晶体结构构建转录延伸复合体模型，可以显示DNA双螺旋和聚合酶中的RNA转录物不同部位的精确位置。 RNA聚合酶β和β‘亚基分别以蓝绿色或者粉红色表示，双螺旋的模板链以红色表示，非模板连以黄色表示，RNA转录物以金黄色表示。 聚合酶并非以恒定的速率合成转录物。相反，转录是不连续的过程，由快速的延伸过程间隔以短暂的停顿，在停顿时聚合酶的活性位点发生了结构重排。 这种停顿在转录的终止中起重要作用。 * 转录不是连续的过程，聚合酶会有规律地停顿，在继续延伸和脱离模板终止转录之间进行选择。终止必然发生在模板上聚合酶解离比继续RNA合成更有利的位点。 细菌中存在两种不同的转录终止机制。 固有终止子分两步促使聚合酶解离，1. 当反向回文序列被转录出来时，转录出来的RNA折叠成一种稳定的发夹结构，这种RNA-RNA配对比转录泡内的DNA-RNA配对更具有热力学上的有利性，因此降低了模板和转录物之间的相互作用，有利于解离。2. 当随后的一系列A被转录为U后，模板和转录物之间的相互作用进一步被减弱，因为形成的A-U碱基对只有两个氢键，而G-C配对有三个氢键。最终的结果是终止比延伸更为有利。 * 在RNA聚合酶β亚基的表面，临近RNA从复合体伸出的通道出口，有一个翼状结构，固有终止子转录产生RNA发夹结构与此翼状结构相接触。尽管翼状结构离聚合酶的活性位点很远，它们之间可以通过β亚基的一个β折叠直接相连。故此，翼状结构会影响活性位点内氨基酸的定位，导致DNA-RNA碱基对的打开和转录的终止。 * 细菌的第二种转录终止信号是ρ-依赖性的。 需要Rho蛋白的活性。Rho可以结合到转录物上，沿着RNA向聚合酶移动。聚合酶停顿下来，Rho可以追上聚合酶，Rho是一种解旋酶，可以打开模板和转录物之间的配对，造成转录终止。 * 当停顿的聚合酶在继续延伸和从模板解离终止转录两者之间做选择时，可以受到其他因素的影响吗？答案是肯定的。 第一种调控机制是抗终止，抗终止蛋白结合到操纵子起始处附近的抗终止位点上，再与RNA聚合酶结合，使RNA聚合酶通过终止信号继续转录。 衰减作用，出现在与氨基酸的生物合成相关的酶的操纵子，如色氨酸操纵子中。 转录物降解蛋白，促进RNA聚合酶本身的RNA降解活性，将新合成RNA分子与模板分离部分降解掉，以防止RNA聚合酶被卡住。 * RNA聚合酶能够忽略一个终止信号继续延伸至下一个终止信号。 抗终止的机制尚不清楚，但对噬菌体感染周期具有重要意义。 * 细菌mRNA初始转录产物即是成熟的mRNA，转录 和翻译同时进行；这为细菌提供了一种特殊的调节方式——衰减作用，对于细菌mRNA合成的调节是至关重要的。 衰减作用主要在编码与氨基酸生物合成相关的酶的操纵子中发挥作用。 色氨酸操纵子是个很好的例子。在这个操纵子中，转录起始点与trpE基因起点间可形成两个发夹：其中小的为终止信号，而大的更靠近起始点也更稳定。 两发夹环位置重叠，一次只能形成一个； RNA聚合酶与RNA转录物5’端核糖体间相对位置决定形成哪一个发夹环： 若核糖体暂停，形成大发夹