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微生物分类及鉴定;第十一章 微生物的分类和鉴定;什么是微生物分类学(microbialtaxonomy);一. M分类学三个组成部分;二. 分类单元及其等级; 根据Carl Woese的理论，现在还在界之上使用域(domain)，即：古生菌域、细菌域、真核生物域。;1. 种(species): 物种，生物分类中基本的分类单元和分类等级。;2. 亚种(subspecies): 是正式分类单元中地位最低的分类等级;型(form或type);4. 菌株(strain) ;三.微生物的命名 ;学名=属名＋种的加词＋（首次定名人）＋现名定名人＋定名年份  必要，用斜体排字 可省略，均用正体排字 例1：大肠埃希氏菌（简称大肠杆菌） Escherichia coli (Migula) Castellani et Chalmers 1919 例2：金黄色葡萄球菌 Staphylococcus aureus Rosenbach 1884 ; 在前后有两个或数个学名排在一起，且在其属名相同的情况下，后一学名中的属名可缩写成一个、两个或三个字母，其后加一点。如： Bacillus可写成“B．”或“Bac．”； Pseudomonas可写成“P．”或“Ps．”； Aspergillus可写成“A．”或“Asp．”等。; 在实际工作中，有时筛选到一个有用的菌种，其属名很易确定，但种名还未确定。在这种情况下，当发表论文或进行学术交流时，其种的加词暂时可以用“sp．”（正体字）代替。例如： “Bacillus sp．”即表示一个尚未定出种名的芽孢杆菌，可译为“一种芽孢杆菌”； “Bacillus spp．”（spp．为species复数的简写）表示一批尚未定种名的芽孢杆菌，故可译为“若干芽孢杆菌”。;亚种名: 三元式组合 属名+ 种名加词 + subsp. 亚种名加词 Alcaligenes denitrificans subsp. xylosoxydans 反硝化产碱杆菌氧化木糖亚种 Bacillus subtilus subsp. nigar 枯草芽孢杆菌黑色亚种 ;系统学系统 Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology 《伯杰氏系统细菌学手册》 1984~1989 第一版（4卷）(以DNA、rRNA为分类依据) 2000~ 第二版（5卷）(以DNA、rRNA、蛋白质序列分析为分类依据); Bacillus sp. Bacillus thuringiensis Escherichia coli Methanococcus jannaschii Penicillium Saccharomyces cerevisiae Staphylococcus aureus Streptomyces ;细菌分类系统----Bergey’s Manual; 真菌分类系统 ;Ainsworth分类系统第八版（1995年）;11.2 微生物分类鉴定的特征和技术; 分子生物学的发展，使我们不仅可以根据表型特征，而且可以从分子水平上，通过研究和比较微生物乃至整个生物界的基因型特征来探讨生物的进化、系统发育和进行分类鉴定。 ;进化的测量指征;一 经典分类鉴定法;不同微生物的不同重点鉴定指标;形态和生理生化特征是最常用的细菌分类、鉴定指标;商品化的细菌鉴定试剂盒有API系统、 Enterotube系统等。;微生物的快速分类鉴定方法;第29页/共37页;第30页/共37页;（一）氨基酸序列和蛋白分析 （二）核酸的碱基组成和分子杂交 （三） rRNA寡核苷酸序列分析;（一）氨基酸的顺序和蛋白质的分析 蛋白质是基因的产物,.蛋白质的氨基酸顺序直接反映mRNA顺序而与编码基因密切相关. 因此,可以通过对某些同源蛋白质氨基酸顺序的比较来分析不同生物系统发育关系,序列相似性越高,其亲缘关系愈近. ;核酸的碱基组成和分子杂交;2. 核酸分子杂交法;（三）rRNA寡核苷酸序列分析; rRNA的序列分析 ;谢谢观看！