蛋白质蛋白质相互作用第二章.pptVIP

第六十二页，共八十八页，2022年，8月28日 第六十三页，共八十八页，2022年，8月28日 第六十四页，共八十八页，2022年，8月28日 碱基总数大于50000的序列的拼接 应用 online 的CAP3 程序允许的最大碱基总数为50000，对于碱基总数大于50000的可选择其它软件进行拼接。 这里我们用Vector NTI 软件进行拼接。 第六十五页，共八十八页，2022年，8月28日 打开ContigExpress Project 程序，导入FASTA格式的文件 第六十六页，共八十八页，2022年，8月28日 第六十七页，共八十八页，2022年，8月28日 第六十八页，共八十八页，2022年，8月28日 第六十九页，共八十八页，2022年，8月28日 第七十页，共八十八页，2022年，8月28日 ... ... 第七十一页，共八十八页，2022年，8月28日 关于电子克隆的一些问题 对于亲缘关系较远的物种宜选择tblastx序列比对EST，这样能获得较多的同源EST。 但如果EST数量太多，则需要设定一定条件筛选掉一部分匹配较差的EST。 EST中经常混有载体序列，应注意在拼接前去除载体部分。 第七十二页，共八十八页，2022年，8月28日 克隆载体的去除 载体的去除可以使用NCBI提供的网上工具VecScreen，网址为 第七十三页，共八十八页，2022年，8月2