基因工程常用的克隆载体.pptxVIP

基因工程常用的克隆载体第1页/共27页第2页/共27页载体的功能运送外源基因高效转入受体细胞为外源基因提供复制能力或整合能力为外源基因的扩增或表达提供必要的条件第3页/共27页第一节 质粒载体第4页/共27页一、质粒的定义 存在于细胞质中的一类独立于染色体，并能自主复制的遗传成分（复制子）复制子:细胞内独立存在的、能够自我增殖的结构单位染色体DNA质粒DNA噬菌体DNA第5页/共27页质粒DNA编码的表型抗性特性抗生素抗性：重金属抗性：毒性阴离子：其他：AmprCmlrKanrStrrTetrHg、Ni、Co、Pd、Zn砷酸盐、亚砷酸盐、硼酸盐、铬酸盐嵌入试剂（EB、吖啶）、辐射、噬菌体代谢特性：冠瘿碱代谢修饰寄主生活方式：植物冠瘿病、发根病第6页/共27页二、质粒DNA分子的特性结构特性SC型 共价闭合环形DNA（cccDNA，covalently closed circular DNA ）OC型 开环DNA（ocDNA，open circular DNA ） L 型 线性DNA（L-DNA，line DNA）第7页/共27页染料结合特性： 呈平面结构的染料（EB）可平嵌入DNA双链碱基对之间。cccDNA由于结构紧密，自由末端较少，可结合染料EB分子比L-DNA少，因此密度较大。提取纯化质粒DNA：氯化铯-溴乙锭密度梯度离心法（CsCl-EtBr）质粒DNA纯度高、周期长、设备要求高、存在溴乙锭污染！第8页/共27页加碱调pH至12～12.5DNA变性去除蛋白质、RNA离心变性特性 cccDNA由于分子较小且结构紧密，碱性条件下变性后，恢复pH条件即可复性。提取纯化质粒DNA：微量碱变性法裂解菌体细胞加NaAc调pH至4.8质粒DNA纯度较低、周期较短！第9页/共27页复制特性拷贝数：生长在标准培养基条件下，每个细胞中所含有的质粒DNA分子的数目严紧型复制：1-2个松弛型复制：10-100个 制备质粒：寄主细胞培养基中加入蛋白质合成抑制剂，增加质粒拷贝数！第10页/共27页三、质粒载体应具备的条件具有复制起始位点具有至少两种易被检测的选择性标记具有多克隆位点（MCS） 多克隆位点（multi-cloning-site，MCS）：多种常用限制酶单一识别序列所组成的DNA序列具有尽可能小的相对分子质量易于分离纯化目的DNA装载能力强拷贝数高多重酶识别位点几率低应属于松弛型复制应为非传递型第11页/共27页EcoR ICla IHind IIIPst IBamH IPvu IPst IrrApTcSal IpBR3224363 bpROIBal IROPHind IIOrigin of Replication四、几种常用的质粒载体 pBR322来源：大肠杆菌Ori：标记基因：apr、tcr分子大小：4363bp拷贝数：50-100/cell第12页/共27页 pUC18来源：大肠杆菌Ori：标记基因：apr、lacZ’MCS：分子大小：2686bp拷贝数：1000-2000/cell第13页/共27页第二节 λ噬菌体载体第14页/共27页λ噬菌体DNA可以作为克隆载体的原因：高效率的感染性能使外源基因高效导入受体细胞自主复制繁殖性能使外源基因在受体细胞中高效扩增λDNA缺失达总量20%的DNA时，仍不影响其特性，可为外源基因提供装载空间第15页/共27页裂解吸附包装注入复制整合溶菌途径烈性噬菌体温和噬菌体原噬菌体营养体溶源菌一、基本概念噬菌体感染周期：E.coli溶源途径第16页/共27页头部：正二十面体、 直径约55nmλDNA：线性、约48kb尾部：长约150nm、粗12nm二、 λ噬菌体的形态结构及繁殖特性形态结构第17页/共27页繁殖特性侵染E.coli溶源菌λ噬菌体裂解浑浊噬菌斑第18页/共27页CCCGCCGCTGGA 5’ COS3’3’COS5’ TCCAGCGGCGGGG溶菌控制基因cos头部合成基因晚期控制基因ARDNA合成控制基因阻遏基因(cΙ、cⅡ)l - DNA早期控制基因尾部合成基因N阻遏基因J重组基因删除与整合基因三、 λDNA的结构及功能左臂区：A→J中间区：J →N右臂区：N →R第19页/共27页形成浑浊噬菌斑形成噬菌斑cΙ基因：编码阻遏蛋白，使参与溶菌周期活动的基因失活cΙ基因表达：溶源途径cΙ基因不表达：溶菌途径第20页/共27页四、 λ噬菌体载体的构建消除多余的限制性内切酶位点点突变基因组置换、缺失增加单一酶切位点去除非必要区段λ噬菌体头部蛋白可包装DNA大小：75～105% λDNA长度（38～52kb）增加筛选标记基因第21页/共27页五、 λ噬菌体载体的主要类型插入型载体： λDNA缺失部分非必要基因，只含有一个或两个可供外源DNA插入的酶切位点特点：承载能力