python在生态学领域运用-适用于生态学家的Python中的数据分析和可视化.pdfVIP

python在⽣态学领域运⽤_适⽤于⽣态学家的Python中的数据 分析和可视化 DataFrame与Pan as结合 总览 问题 我可以使⽤来 ⾃多个来源的数据吗？ 如何合并来 ⾃不同数据集的数据？ ⽬标 使⽤merge和concat将多个⽂件中的数据合并到单个DataFrame中。 使⽤在两个DataFrame中找到的唯⼀ID组合两个DataFrame。 聘请to_csv导出CSV格式的数据帧。 使⽤公共字段(联接键)联接DataFrame。 在许多 “现实世界”情况下，我们要使⽤的数据位于多个⽂件中。我们经常需要将这些⽂件组合到单个DataFrame中以分析数据。pan as 包提供了多种组合DataFrame的⽅法，包括merge和concat。 为了完成下⾯的⽰例，我们⾸先需要将物种和调查⽂件加载到pan as DataFrames中。在iPython中： import pan as as p surveys_ f = p .rea _csv ( ata/surveys.csv, keep_ efault_na=False, na_values=[]) surveys_ f recor _i month ay year plot species sex hin foot_length weight 0 1 7 16 1977 2 NA M 32 NaN 1 2 7 16 1977 3 NA M 33 NaN 2 3 7 16 1977 2 DM F 37 NaN 3 4 7 16 1977 7 DM M 36 NaN 4 5 7 16 1977 3 DM M 35 NaN ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... 35544 35545 12 3 1 2002 15 AH NaN NaN NaN 35545 35546 12 3 1 2002 15 AH NaN NaN NaN 35546 35547 12 3 1 2002 10 RM F 15 14 35547 35548 12 3 1 2002 7 DO M 36 5 1 35548 35549 12 3 1 2002 5 NaN NaN NaN NaN [35549 rows x 9 columns] species_ f = p .rea _csv ( ata/species.csv, keep_ efault_na=False, na_values=[]) species_ f species_i genus species taxa 0 AB Amphispiza bilineata Bir 1 AH Ammospermophilus harrisi Ro ent 2 AS Ammo ramus savannarum Bir 3 BA Baiomys taylori Ro ent 4 CB Campylorhynchus brunneicapillus Bir .. ... ... ... ... 49 UP Pipilo sp. Bir 50 UR Ro ent sp. Ro ent 5 1 US Sparrow sp. Bir 52 ZL Zonotrichia leucophrys Bir 53 ZM Zenai a macroura Bir [54 rows x 4 columns] 请注意，rea _csv我们使⽤的⽅法可能会包含⼀些以前未使⽤的其他选项。Python中的许多功能都有⼀组选项，⽤户可以根据需要设置这 些选项。在这种情况下，我们告诉熊猫在CSV 中将空值分配给NaNkeep_ efault_na=False, na_values=[]。有关所有rea _csv选项的 更多信息，请参见此处。 串联数据框 我们可以concat在pan as中使⽤该函数将⼀个DataFrame的列或⾏追加到另⼀个。让我们获取数据的两个⼦集，以了解其⼯作原理。 # Rea in first 10 lines of surveys table survey_sub = surveys_ f.hea (10) # Grab the last 10 rows survey_sub_last 10 = surveys_ f.tail