第二章人类基因组计划演示文稿.pptVIP

欧共体 1990年6月欧共体通过了“欧洲人类基因组研究计划”，主要资助23个实验室重点用于“资源中心”的建立和运转。还有丹麦、俄罗斯、日本、韩国、澳大利亚等。 当前第30页\共有63页\编于星期三\9点 HGP的研究内容 HGP的主要任务是人类的DNA测序，内容是完成4张图谱：物理图谱、遗传图谱 、序列图谱 和转录图谱，这四张图称为“人类基因解剖图” 。 样本选择人种：白种、黑种和黄种3大人种，并在样本选择前，移除所有的标识物。 当前第31页\共有63页\编于星期三\9点 物理图谱 根据DNA序列上的碱基位置来确定基因的位置，是确定基因的顺序和间隔的最基本的工作。 绘制物理图谱的目的是把有关基因的遗传信息及其在每条染色体上的相对位置线性而系统地排列出来。 当前第32页\共有63页\编于星期三\9点 遗传图谱 又称连锁图谱，是根据基因之间的连锁关系构建的。它是以具有遗传多态性（在一个遗传位点上具有一个以上的等位基因，在群体中的出现频率皆高于1%）的遗传标记为“路标”，以遗传学距离（在减数分裂事件中两个位点之间进行交换、重组的百分率，1%的重组率称为1cM）为图距的基因组图。 遗传图谱的建立为致病基因识别和基因定位创造了条件。 当前第33页\共有63页\编于星期三\9点 转录图谱 又称cDNA图谱，是用基因表达的各种 mRNA产物在识别基因组所包含的蛋白质编码序列的基础上绘制的结合有关基因序列、位置及表达模式等信息的图谱。在人类基因组中鉴别出占具2%~5%长度的全部基因的位置、结构与功能，最主要的方法是通过基因的表达产物mRNA反追到染色体的位置。 RNA DNA 逆转录酶 当前第34页\共有63页\编于星期三\9点 序列图谱 序列图谱是指完整的人类基因组图谱，是人类基因组计划中最重要、最难“画”的一张图。 DNA序列分析技术是一个包括制备DNA片段化及碱基分析、DNA信息翻译的多阶段的过程，通过测序得到基因组的序列图谱。 HGP能提前完成，在一定程度上也是分子生物学技术的迅速发展，尤其是DNA测序的自动化和生物芯片技术的问世。 当前第35页\共有63页\编于星期三\9点 国际HGP测序采用逐个克隆法：对连续克隆系中排定的BAC克隆逐个进行亚克隆测序并进行组装。 美国Celera公司采用全基因组鸟枪法：在一定作图信息基础上，直接将基因组分解成小片段随机测序，利用超级计算机进行组装。? 当前第36页\共有63页\编于星期三\9点 Shotgun测序 DNA的提取和纯化 载体预备：和DNA片断结合，从而能够在细菌中扩增。 DNA片段的制备：将DNA用超声波切成能够测序的小片断 转化培养：小片断和载体结合，植入细菌中进行扩增。 提质粒：从细菌中提取出繁殖好的质粒 电泳检测：检测质量的好坏 测序：上测序仪测序 当前第37页\共有63页\编于星期三\9点 当前第38页\共有63页\编于星期三\9点 全自动的测序仪器：MegaBace 当前第39页\共有63页\编于星期三\9点 DNA测序峰形图 当前第40页\共有63页\编于星期三\9点 我国科学家在基因组研究中的测序图谱 当前第41页\共有63页\编于星期三\9点 当前第42页\共有63页\编于星期三\9点 人类基因组特点 到2003年，六国科学家完成了人类基因99.9％的测序工作，1％目前无法测序。 人类全套染色体图 当前第43页\共有63页\编于星期三\9点 1. 基因数目比想象的要少的多，人类基因组的DNA由3×109个碱基对组成，人类只有2～3万个遗传基因，编码序列不足总基因量的5％，这相当于线虫、果蝇遗传基因数的2倍，仅比老鼠多几百个遗传基因。 如此少的基因数目，而能产生如此复杂的功能，说明基因组的大小和基因的数量在生命进化上可能不具有特别重大的意义，也说明人类的基因较其他生物体更有效，人类某些基因的功能和控制蛋白质产生的能力与其他生物的不同。 当前第44页\共有63页\编于星期三\9点 2. 人类基因组中存在“热点”和大片“荒漠”。 在染色体上有基因成簇密集分布的区域，也有大片的区域只有“无用DNA” ——不包含或含有极少基因的成分。基因组上大约有1／4的区域没有基因的片段。在所有的DNA中，只有1%-1.5%DNA能编码蛋白，在人类基因组中98%以上序列都是所谓的“无用DNA”，35.3％的基因组包含重复序列。 这些重复的“无用”序列，决不是无用的，它一定蕴含着人类基因的新功能和奥秘，包含着人类演化和差异的信息。经典分子生物学认为一个基因只能表达一种蛋白质，而人体中存在着非常复杂繁多的蛋白质，提示一个基因可以编码多种蛋白质，蛋白质